| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3057317 = | 94 (1.290) | 6 (0.090) | 5/236 | NT | 6.5% | coding (74/990 nt) | PP_2669 | outer membrane protein |
| ? | NC_002947 | 3057349 = | 83 (1.200) | coding (42/990 nt) | PP_2669 | outer membrane protein | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCACGCGGGCGCTGGCCCACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGCCCTC > NC_002947/3057200‑3057498 | agcctgggctatgacaagcccgaagtgacgtgtagctacccctgacccgacaaccacaacaataaggaatccgccatgcgccgccccctcttccaccgggccctgctttaccccagcCTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAgg > 2:524218‑M1/118‑150 (MQ=255) cACGCGGGCGCTGGCCCACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGc > 2:1074846/1‑150 (MQ=255) cACGCGGGCGCTGGCCCACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGCCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCCGGCCAG‑‑CGCCAGGGAGCACGACAGCAggg > 2:244737/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGGCCCGCCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTgggg < 1:391553/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCCACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTa > 2:1434615/1‑150 (MQ=255) ccACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAggg > 1:1655721/1‑150 (MQ=255) ccACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAgg > 2:1586873/1‑149 (MQ=255) ccACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAgg < 1:1586873/149‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGaa < 2:1917005/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGaa > 2:433883/1‑150 (MQ=255) tttCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAaga < 1:1809413/150‑1 (MQ=255) gTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGTTGTGACTGCTGGCCCGCACGCCGGGATATCCAACA‑‑AGGGTGGGGGAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAggggg > 1:1399046/1‑150 (MQ=255) gACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGggcg < 2:1004265/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGgcggcg > 1:773266/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGCGGGAGCCATGGGTTGACTGCTGGCCAG‑‑AGAGCGCGCGTCTGACCTCCGGTCCGTGTTAAGCAGGGCTTGGTGGAAGGGGGggcgggg > 1:1886117/1‑148 (MQ=255) ccAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCa > 1:741632/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCa < 1:1364098/150‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATg > 1:617645/1‑150 (MQ=255) 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ggctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATtgttgt < 1:1309550/150‑1 (MQ=255) gctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAg > 2:1394470/1‑99 (MQ=255) gctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAg < 1:1394470/99‑1 (MQ=255) gctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTtgtg > 2:1003957/1‑150 (MQ=255) gctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTtgtg < 2:1819619/150‑1 (MQ=255) ctggggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTgg > 2:1121294/1‑150 (MQ=255) ctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTgg < 1:901723/150‑1 (MQ=255) ctgaggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTgg > 2:1405976/1‑150 (MQ=255) gaggctgTTCTCCTTCTCGTTGACGCCCAAGGACGCGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGtt < 2:101706/150‑1 (MQ=255) ggctgTTGTCGTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCGCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGt < 2:1886117/150‑1 (MQ=255) ggctgTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGt > 2:15505/1‑150 (MQ=255) 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cAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTc > 1:715792/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGa < 2:715792/150‑1 (MQ=255) ctggcgctggccagcagTCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAg > 1:1632426‑M2/18‑150 (MQ=255) aGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAg < 1:1121294/150‑1 (MQ=255) gggCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTc > 2:813304/1‑67 (MQ=255) gggCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTc < 1:813304/67‑1 (MQ=255) cccGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGaa < 1:62471/143‑1 (MQ=255) cccGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGaa > 2:62471/1‑143 (MQ=255) cccGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGc < 1:179453/150‑1 (MQ=255) cccGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTGGTTTTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGc < 2:1425252/150‑1 (MQ=255) acaccagGCTGGGGTCAAGCAGGGCCCGGGGGAAGAGGGGGCGCCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGCTGGTCCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGa < 1:436209‑M2/143‑1 (MQ=255) cagGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGcc > 2:1316838‑M2/4‑150 (MQ=255) cagGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCACGGTAAATGCTGTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGcc < 1:435959‑M2/147‑1 (MQ=255) gGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGaa < 1:1109398‑M2/144‑1 (MQ=255) gGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGaa > 2:1109398‑M2/2‑145 (MQ=255) gCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGCcctc > 2:190650/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTACATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGCcctc > 2:1403386/1‑150 (MQ=255) | CCACGCGGGCGCTGGCCCACCGGCAGGGTTTCGGTGACTTCCAGCGTTTGCAGGTCGATCAGGCTGAGGCTGTTGTCCTTCTCGTTGGAGACCCAGGCGGTGGCAGCCATGGTGTGACTGCTGGCCAG‑‑CGCCAGGGCGCCCGACAGCAGGCTGGGGTAAAGCAGGGCCCGGTGGAAGAGGGGGCGGCGCATGGCGGATTCCTTATTGTTGTGGTTGTCGGGTCAGGGGTAGCTACACGTCACTTCGGGCTTGTCATAGCCCAGGCTGTCCATTTCGTTGAAGGGATGCAGGAAGCCCTC > NC_002947/3057200‑3057498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |