New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4016197 | 60 (0.820) | 6 (0.080) | 6/246 | NT | 9.1% | coding (55/1410 nt) | PP_3544 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4016216 | 60 (0.830) | coding (74/1410 nt) | PP_3544 | GntR family transcriptional regulator |
TCGTCGCCCCCATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCACGTTCCGCGTCA > NC_002947/4016070‑4016360 | tcgtcgCCCCCATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGt < 1:1623824/150‑1 (MQ=255) tcgCCCCCATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGcc < 2:1609850/150‑1 (MQ=255) tcgCCCCCATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGcc < 1:480851/150‑1 (MQ=255) cccccATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGccgtc > 2:1738951/1‑150 (MQ=255) ccccATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGACCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGTCC‑AGCGCGTg > 1:1362649/1‑144 (MQ=255) ccccATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGACCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGTCC‑AGCGCGTg < 2:1362649/144‑1 (MQ=255) ccATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCGTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCTCGGGCC‑AGCTCGTGccgtccgt > 1:911463/1‑150 (MQ=255) gAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTgcgc < 2:889754/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGt > 2:1797405/1‑128 (MQ=255) aTCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGt < 1:1797405/128‑1 (MQ=255) aTCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACgccagc < 1:1738951/150‑1 (MQ=255) aTCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACgccagc < 1:633440/150‑1 (MQ=255) cTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGa > 2:852827/1‑150 (MQ=255) cTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGa < 1:644839/150‑1 (MQ=255) cTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGCGCTGG‑CCGGGGCCCAGCAccccggagcggatcag < 1:941612‑M2/137‑17 (MQ=255) cTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGCGCTGG‑CCGGGGCCCAGCAccccggagcggatcag > 2:941612‑M2/1‑121 (MQ=255) tCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGccgt < 2:853883/122‑1 (MQ=255) tCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGccgt > 1:853883/1‑122 (MQ=255) cACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACggg < 2:1585575/150‑1 (MQ=255) cACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTCCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACggg < 2:777660/150‑1 (MQ=255) gCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTc > 2:136067/1‑150 (MQ=255) ttGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCg > 2:819803/1‑150 (MQ=255) tgcctgccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAGCGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGt < 1:1366273/150‑1 (MQ=255) gcctgccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTc < 1:852827/150‑1 (MQ=255) ctgccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTa > 2:1096976/1‑150 (MQ=255) tgccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTAc > 2:63381/1‑150 (MQ=255) gccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGccc < 2:1671813/143‑1 (MQ=255) gccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGccc > 1:1671813/1‑143 (MQ=255) ccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACgccagcc > 1:252569/1‑123 (MQ=255) ccAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACgccagcc < 2:252569/123‑1 (MQ=255) aGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCgtg > 1:838092/1‑150 (MQ=255) ggCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCgtgt < 2:838092/150‑1 (MQ=255) gCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGtt > 1:1942452/1‑150 (MQ=255) tGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCa < 1:63381/150‑1 (MQ=255) ggACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAg > 1:1174104/1‑150 (MQ=255) gACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAgg > 1:1782102/1‑150 (MQ=255) aCAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGc < 2:1942452/150‑1 (MQ=255) aGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCt < 2:1782102/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCt > 2:264944/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCt < 1:264944/149‑1 (MQ=255) cAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGAccc < 1:1466082/110‑1 (MQ=255) cAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGAccc > 2:1466082/1‑110 (MQ=255) tGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTgg > 2:938162/1‑150 (MQ=255) aaCGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACggg < 2:239718/107‑1 (MQ=255) aaCGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACggg > 1:239718/1‑107 (MQ=255) aCGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACg > 1:592081/1‑150 (MQ=255) gCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGgc > 1:1917686/1‑150 (MQ=255) cTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGgcg < 2:1156827/150‑1 (MQ=255) aaCGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGc < 2:1374092/150‑1 (MQ=255) aaCGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGc < 2:1174104/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATc < 2:592081/150‑1 (MQ=255) gATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGcc > 1:359310/1‑150 (MQ=255) gATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGcc > 1:1353503/1‑150 (MQ=255) cGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTc > 2:1055813/1‑150 (MQ=255) cGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGAAGCGTATCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTc > 1:50096/1‑150 (MQ=255) tGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGt > 2:1155108/1‑150 (MQ=255) cGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGccccggagcggatcagttcggcaatgtcatcggcgaagcgttcgtagcgtttcatt < 2:1257783‑M2/85‑57 (MQ=255) cGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGccccggagcggatcagttcggcaatgtcatcggcgaagcgttcgtagcgtttcatt > 1:1257783‑M2/1‑29 (MQ=255) cGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCaa < 1:1055813/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCAccccggagcggatcagttcggcaatgtcatcggcgaagcgttcgtagcgtttcattctggccttctgtccaagcctggcaggcaaggtggcgtgagtgtaagggatcagcggttcatgggg > 2:86557‑M2/1‑20 (MQ=255) gTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCAccccggagcggatcagttcggcaatgtcatcggcgaagcgttcgtagcgtttcattctggccttctgtccaagcctggcaggcaaggtggcgtgagtgtaagggatcagcggttcatgggg < 1:86557‑M2/141‑122 (MQ=255) gCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCa > 1:1882762/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCAc > 2:516421/1‑150 (MQ=255) cTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCAc > 1:599521/1‑150 (MQ=255) tGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCcgc < 1:1604224/113‑1 (MQ=255) tGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCcgc > 2:1604224/1‑113 (MQ=255) ggCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCgt < 1:1557070/68‑1 (MQ=255) ggCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCgt > 2:1557070/1‑68 (MQ=255) cccGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAgg > 2:1779983/1‑73 (MQ=255) cccGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAgg < 1:1779983/73‑1 (MQ=255) cc‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCACGTTCCGCGTCa < 2:1917686/150‑1 (MQ=255) cc‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCACGTTCCGCGTCa < 1:1096976/150‑1 (MQ=255) cc‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATGTCGTAAACGCACACGTTCCGCGTcg > 1:389680/1‑149 (MQ=255) | TCGTCGCCCCCATGAACCGCTGATCCCTTACACTCACGCCACCTTGCCTGCCAGGCTTGGACAGAAGGCCAGAATGAAACGCTACGAACGCTTCGCCGATGACATTGCCGAACTGATCCGCTCCGGGGTGCTGGGCCCCGGCC‑AGCGCGTGCCGTCCGTGCGCTACGCCAGCCAGACCCACGGGGTCAGCCCGTCTACCGTGTTCCAGGCCTATTACCTGCTGGAACGGCGCGGGCTGATCCGCGCCCGGCCGCGCTCCGGGTATTTCGTCAACGCCCACGTTCCGCGTCA > NC_002947/4016070‑4016360 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |