New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5036230 | 28 (0.380) | 6 (0.080) | 6/242 | NT | 12.5% | intergenic (+686/‑11) | PP_4439/PP_4441 | transposase/transposase |
? | NC_002947 | 6155313 = | 57 (0.800) | intergenic (‑67/+139) | PP_5398/PP_5399 | transposase/hypothetical protein |
TGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGCTGCTGCATTCAGACGGCCA > NC_002947/6155206‑6155462 | tGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt > 2:31747/1‑146 (MQ=33) tGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt < 1:31747/146‑1 (MQ=33) cTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGt < 2:875475/150‑1 (MQ=40) tttGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGtt > 2:1740711/1‑150 (MQ=40) tttGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGtt < 2:1778407/150‑1 (MQ=40) ttGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTc < 2:368655/150‑1 (MQ=255) gAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGGTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCga < 1:1299676/150‑1 (MQ=255) aaCGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt > 2:1723850/1‑137 (MQ=33) aaCGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt < 1:1723850/137‑1 (MQ=33) gTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACgg < 1:1561174/150‑1 (MQ=255) tttCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACggg > 2:1417395/1‑150 (MQ=255) aTAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGGAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCTGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATTCGTGCGAGACGGGAGCaga > 2:1413180/1‑150 (MQ=255) aTAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCaga > 2:1321288/1‑150 (MQ=255) aTAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCaga < 2:1106232/150‑1 (MQ=255) gagCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTg > 1:277223/1‑150 (MQ=255) gagCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTg > 2:1712665/1‑150 (MQ=255) gagCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGACTTTGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTg < 1:19100/150‑1 (MQ=255) agCTTGGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGt > 2:1933142/1‑150 (MQ=255) cTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGt > 1:1655468/1‑121 (MQ=35) cTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGt < 2:1655468/121‑1 (MQ=35) tgcGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAAGAAGGGTGATGGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCGGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTGGAGACGGGAGCAGAATTGTACt > 2:1315/3‑150 (MQ=17) ttGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCt < 2:1148210/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCt < 2:277223/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCt < 1:487064/150‑1 (MQ=255) tGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTg < 2:654721/150‑1 (MQ=255) gcgcATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGa < 1:1712665/150‑1 (MQ=255) aTGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCa > 1:453577/1‑150 (MQ=255) gAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAggg < 1:1223143/150‑1 (MQ=255) cgaactccagcattaagggcgatggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttattgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTg > 1:1855249‑M2/66‑132 (MQ=255) cgaactccagcattaagggcgatggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttattgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTg < 2:1855249‑M2/67‑1 (MQ=255) aactccagcattaagggcgatggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttaatgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCGCCGGAc > 2:890312‑M2/64‑91 (MQ=255) aactccagcattaagggcgatggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttaatgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCGCCGGAc < 1:890312‑M2/28‑1 (MQ=255) aTCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGCGTCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGaaa > 1:1789211/1‑150 (MQ=255) tGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt > 1:1196447/1‑97 (MQ=35) tGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCt < 2:1196447/97‑1 (MQ=35) tGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAg > 2:814994/1‑150 (MQ=255) aaTAAGGGTGATCGCGGCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGGCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGCGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGc > 2:650443/1‑150 (MQ=255) aTAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCg > 1:1376096/1‑150 (MQ=255) tAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAAAACGCGGACACCAGGACCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGAAGGGAGCAGAGTTCTACTTTCTGTACACAGGGAAATCACGTGccg < 2:611670/150‑3 (MQ=21) gggTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCaga < 2:1433848/112‑1 (MQ=255) gggTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCaga > 1:1433848/1‑112 (MQ=255) gggTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAgg > 1:1003927/1‑133 (MQ=255) gggTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAgg < 2:1003927/133‑1 (MQ=255) gTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTa > 1:895147/1‑150 (MQ=255) tGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTg > 2:233078/1‑122 (MQ=255) tGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTg < 1:233078/122‑1 (MQ=255) tGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCa < 2:517103/128‑1 (MQ=255) tGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCa > 1:517103/1‑128 (MQ=255) atggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttattgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACg > 1:1729153‑M2/45‑99 (MQ=255) atggtgtccgcgtatttttaagcggacgcgatcacccttattgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACg < 2:1729153‑M2/55‑1 (MQ=255) aTCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTgg > 1:1130001/1‑121 (MQ=255) aTCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTgg < 2:1130001/121‑1 (MQ=255) aTCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTg > 2:1848465/1‑150 (MQ=255) aTCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTg < 2:453577/150‑1 (MQ=255) cGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAAttt > 2:1402778/1‑150 (MQ=255) gCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCTGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTGCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTc < 1:1413180/150‑1 (MQ=255) aTACGCGGACACCATCACCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAACTACTGCAGAATTTGCCCAAAgg > 1:523837/1‑149 (MQ=255) gcgGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAg > 2:727261/1‑145 (MQ=255) gcgGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAg < 1:727261/145‑1 (MQ=255) gcgGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTcc > 1:1334428/1‑150 (MQ=255) ggACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCaa < 1:1933142/150‑1 (MQ=255) ccATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAgctgc < 1:1740711/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGTGTTCAGAGTAGTACTTTGTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGctgctg > 1:628368/1‑150 (MQ=38) cTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGaa < 2:922705/95‑1 (MQ=255) cTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGaa > 1:922705/1‑95 (MQ=255) tgcTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGCTGCTGCATTCAGACgg < 2:895147‑M2/147‑1 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGCGACGACAGGCCGGGTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGCTGCTGCATTCAGACGGCCa > 2:1233319/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGAc < 1:1599665/54‑1 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGAc > 2:1599665/1‑54 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGc < 1:1456902/96‑1 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGc > 2:1456902/1‑96 (MQ=255) tGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGCAGGGTTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGCTGCTGCATTCAGACGGCCa < 1:1321288/150‑1 (MQ=255) | TGGGCTTTGAACGGTTTCGGATAAGAGCTTCGTTGGCGCATGGAAATCCTGGCAATAAGGGTGATCGCGTCCGCTTAAAAATACGCGGACACCATCGCCCTTAATGCTGGAGTTCGGAAGGTGAGTTCCCCGGACGCTTACTCGCTGTATGCGTTCGAGACGGGAGCAGAGTTGTACTTTCTGGACGCAGGGAAATCAGGTGCGGAAGTACTGCAGAATTTCCTCAAAGTTTCCAAGCTGCTGCATTCAGACGGCCA > NC_002947/6155206‑6155462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |