| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5061570 = | 70 (0.960) | 4 (0.060) | 4/238 | NT | 6.1% | coding (199/1098 nt) | PP_4459 | transposase |
| ? | NC_002947 | 5061594 = | 56 (0.800) | coding (223/1098 nt) | PP_4459 | transposase | |||||
TAGCCAGCGCGATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGCCAGCGTT > NC_002947/5061446‑5061743 | tAGCCAGCGCGATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCCCCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGt < 1:1193793/150‑1 (MQ=255) gcgcGATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGAttt < 2:793518/150‑1 (MQ=255) gcgATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGc < 2:1521987/150‑1 (MQ=255) gcgATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGc > 1:1485443/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTGGATTTGCCg > 1:1914147/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCg < 2:1485443/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGc > 2:616804/1‑150 (MQ=255) taGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGcc < 1:103168/149‑1 (MQ=255) gAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGcc > 1:1468726/1‑150 (MQ=255) gtgtAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGc < 1:72820/150‑1 (MQ=255) aaTCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTc < 1:1897767/150‑1 (MQ=255) aTCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGCCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGACTTCa < 1:451599/150‑1 (MQ=255) tCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCAt > 1:1180127/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATtgcctgc < 1:1621939/150‑1 (MQ=255) cGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGa > 2:919044/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGaa > 2:515378/1‑150 (MQ=255) gCTAAACGTCATTCACGTAATGAAATCGCCGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGaa < 2:792671/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAg > 2:442533/1‑150 (MQ=255) aaGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCt < 1:515378/150‑1 (MQ=255) aGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCtt > 2:421453/1‑150 (MQ=255) aGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTACGAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCtt < 1:442533/150‑1 (MQ=255) ggTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTg > 1:1151345/1‑150 (MQ=255) aTTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGCCGCCGCAAACCGGCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGc > 2:1871491/1‑150 (MQ=255) aTTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGc > 2:1625269/1‑150 (MQ=255) aTTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATGGCCTGCCGAAGCCTTGCAGc > 1:99770/1‑150 (MQ=255) aTTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCAGCAAACCGTCATGTCCTGCCGAAGCCTGCCAGc > 2:1870835/1‑150 (MQ=255) tCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGa < 2:1151345/150‑1 (MQ=255) gTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAacac > 2:1813847/1‑150 (MQ=255) tCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAgg < 1:1141231/150‑1 (MQ=255) tgcaaggcttcggcaggcaatgaaggcttgcggcctcgccccggcaaatctacCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAg < 2:1669650‑M1/28‑1 (MQ=255) tgcaaggcttcggcaggcaatgaaggcttgcggcctcgccccggcaaatctacCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAg > 1:1669650‑M1/54‑81 (MQ=255) aCTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcg > 1:1819923/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgc < 1:421453/150‑1 (MQ=255) tGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCg < 1:1494567/79‑1 (MQ=255) tGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCg > 2:1494567/1‑79 (MQ=255) tGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgcg > 1:1909631/1‑150 (MQ=255) tGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgcg > 2:1515821/1‑150 (MQ=255) tGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTAACCCGATGGTGAAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgcg > 2:1677854/1‑150 (MQ=255) gCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCa > 1:102288/1‑150 (MQ=255) ccTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCCGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCAt > 2:461705/1‑150 (MQ=255) ctctCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGTGGTTTCAAGTCCTGTGTCTTCAGGGCTTTGTAGATTTGCCGGGGCGAGGTCGTAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCACCCGCGCATc < 2:102288/150‑1 (MQ=255) ctcCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCggg > 1:1073472/1‑75 (MQ=255) ctcCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCggg < 2:1073472/75‑1 (MQ=255) ccGGGGTTTCCGTCACCCGCTGATGCAAGCGGTTTCGAGGACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACGTGCGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTc < 2:1085223/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCAc < 2:509817/129‑1 (MQ=255) ggTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCAc > 1:509817/1‑129 (MQ=255) cGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGc < 1:807614/150‑1 (MQ=255) cccggcaaatctacCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGc < 2:1931851‑M1/34‑1 (MQ=255) cccggcaaatctacCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGc > 1:1931851‑M1/15‑48 (MQ=255) gTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCa < 1:894011/129‑1 (MQ=255) gTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCa > 2:894011/1‑129 (MQ=255) gcaaatctaccaagccctgaagacgcagtgcttgGTAGATTTGCCggg < 2:1931851‑M2/14‑1 (MQ=255) gcaaatctaccaagccctgaagacgcagtgcttgGTAGATTTGCCggg > 1:1931851‑M2/35‑48 (MQ=255) cAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCAt > 1:1222537/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACTCTGGAGCTGCCGTAGCATg < 1:1515821/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATg < 2:99770/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATgg > 1:1628247/1‑150 (MQ=255) ctaccaagccctgaagacgcagtgcttgGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCa < 2:1669650‑M2/53‑1 (MQ=255) ctaccaagccctgaagacgcagtgcttgGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCa > 1:1669650‑M2/29‑81 (MQ=255) tttCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCgt < 2:1652635/150‑1 (MQ=255) AAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGaa > 1:1777793‑M1/1‑81 (MQ=255) AAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGaa < 2:1777793‑M1/81‑1 (MQ=255) AAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCg < 1:503515‑M1/150‑1 (MQ=255) CACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTg > 1:1677854‑M1/1‑150 (MQ=255) aCTGGGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgc < 1:1852366/101‑1 (MQ=255) aCTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACcgc > 2:1852366/1‑101 (MQ=255) tCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAACCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTtc < 1:1871491/150‑1 (MQ=255) tCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAACCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTtc < 1:1870835/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCCCCCCCCTCCGAAGCCTTGCAGCTAACACTTCAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTtctc < 1:919044/150‑1 (MQ=255) gggCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACtt < 2:1343738/70‑1 (MQ=255) gggCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACtt > 1:1343738/1‑70 (MQ=255) ggCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGcc > 2:1765581/1‑150 (MQ=255) cttgGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGAGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGCCAg > 1:793545‑M2/5‑150 (MQ=255) gTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGCCAGCGtt < 1:461705/150‑1 (MQ=255) gTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGCCAGCGtt > 2:1077350/1‑150 (MQ=255) | TAGCCAGCGCGATGGCCGTCGAGCACGTGTAATCTTGCTGGCCGCTCAAGGTCATTCACGTAATGAAATCGCTGAGCTGACTGGCCTCTCCGTGGTTTCCGTCACCCGCTGGTGCAAGCGGTTTCAAGCACTGCGTCTTCAGGGCTTGGTAGATTTGCCGGGGCGAGGCCGCAAGCCTTCATTGCCTGCCGAAGCCTTGCAGCGAACACTTGAGCAGGTCACTCAACCGCGCATCGGTCAGCCACGCTGGAGCTGCCGTAGCATGGCGCGTGTCGCTGGTATTTCTCCTGCCAGCGTT > NC_002947/5061446‑5061743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |