| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5292940 | 69 (0.950) | 4 (0.060) | 4/236 | NT | 5.2% | coding (1495/1527 nt) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 5292973 | 79 (1.140) | coding (1462/1527 nt) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase | |||||
GCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAATATCAATTT > NC_002947/5292828‑5293122 | gCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATATACATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTgacg > 2:1727926‑M2/1‑146 (MQ=255)gCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTgacg > 1:679478‑M2/1‑146 (MQ=255)gCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTgacg > 1:1754967‑M2/1‑146 (MQ=255) 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aTCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTg > 2:1940752/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGa < 2:1251272/150‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGa < 1:1913297/150‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGa > 1:1876060/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTGGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAgtgt > 2:935873/1‑150 (MQ=255) 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aTCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGAc > 2:795609/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGt > 2:1833304/1‑114 (MQ=255) aaCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGt < 1:1833304/114‑1 (MQ=255) aaCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTgg < 1:1793774/150‑1 (MQ=255) aCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcg < 2:1152393/123‑1 (MQ=255) aCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcg > 1:1152393/1‑123 (MQ=255) gCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAat > 2:439525/1‑150 (MQ=255) gCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAat < 1:1158863/150‑1 (MQ=255) gCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGCACCGCCCCAGGTCCCCGAGTTTGGACCCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAat < 1:1258091/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAata < 1:1914324/150‑1 (MQ=255) gAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGTCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAatat > 1:48366/1‑150 (MQ=255) gCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTTCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAATATCa < 2:453663/150‑1 (MQ=255) tGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAATATCAAttt > 1:1245891/1‑150 (MQ=255) tGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAATATCAAttt > 2:276431/1‑150 (MQ=255) | GCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGCCGACCTGGCCAATATCAATTT > NC_002947/5292828‑5293122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |