New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5796767 | 72 (0.990) | 6 (0.090) | 6/236 | NT | 7.8% | coding (1189/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
? | NC_002947 | = 5796785 | 74 (1.070) | coding (1171/4446 nt) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
GCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATA > NC_002947/5796638‑5796933 | gCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTgg > 2:527391‑M2/1‑148 (MQ=255) cGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTAACGGACCCTGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGCCC‑GACACGGCCCTTggc > 2:990588‑M2/1‑147 (MQ=255) ccTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCa < 2:1416789/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCTAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCAAGCAc > 1:125073/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCAc > 2:945141/1‑150 (MQ=255) gggTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAg > 2:291820/1‑150 (MQ=255) gggTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAg < 2:1161221/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGc < 1:548067/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGa > 2:316167/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa < 2:1535277/142‑1 (MQ=255) gTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCa > 1:1535277/1‑142 (MQ=255) gTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATa > 2:39169/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATa < 1:166504/150‑1 (MQ=255) gTGCTGACGCAGCCAGCGCCTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTAGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTCGCC‑C‑GGGCC‑GACAAGGACCTTGGCCAGCACTTCCCCAGGCTCATa > 2:376167/1‑150 (MQ=255) tGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGccc > 2:1108762/1‑150 (MQ=255) tGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGccc < 1:291820/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GAGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATa > 2:736686/1‑150 (MQ=255) agcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTGTTTGTCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGa < 2:1124521/150‑1 (MQ=255) agcGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGAGGTCCACGGCAAGGACCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCCGGACTTCCTCAGGCGGAGCGCCCCGTACG‑CCGa > 2:420275/1‑150 (MQ=255) cTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGTCCCATACG‑CCGATTTc < 1:316167/150‑1 (MQ=255) cTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTc < 1:1108762/150‑1 (MQ=255) cTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTc < 2:694445/150‑1 (MQ=255) gTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGa < 1:575377/150‑1 (MQ=255) 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aCTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGCTGGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGt > 2:1609148/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCCAC‑GGGCC‑GTGTCGGCCCGgccagatccttgccgtgga > 1:1609306‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCATTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTaa > 1:1073458/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑AAGGGCC‑GTGTCGGCCCGgccagatccttgccgtgga < 2:1609306‑M2/109‑20 (MQ=255) tCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAAc < 1:1077293/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAAcc < 1:945141/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCG‑GACACGGCGCTCGGGCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGGAATGGAACCAtt > 1:1592654/1‑150 (MQ=255) gCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCAtt > 2:589594/1‑150 (MQ=255) cGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtg < 2:764763/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGATGGCGTCGTTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCACGGAT‑AGGCG‑A‑TATCCACACGCGGGTCCTAGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATcggt < 1:137783/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggt < 1:589594/150‑1 (MQ=255) 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ggATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtggtg < 1:1381428/101‑1 (MQ=255) ggATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATtggtggtg > 2:1381428/1‑101 (MQ=255) gCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg < 2:1555473/150‑1 (MQ=255) gCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCAATGTG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTggcg > 1:1108036/1‑150 (MQ=255) c‑GGGCC‑GACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgaccccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagc > 2:176259‑M2/1‑18 (MQ=255) c‑GGGCC‑GACACGGCCCTTggccagatccttgccgtggacaccgaaaccggccagatcctcgacaccgaccccatcgacaaccgcctgaagtcgcgccacccgtacaagc < 1:176259‑M2/109‑92 (MQ=255) gggCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCt < 1:1154084/150‑1 (MQ=255) agCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCtt > 2:1328001/2‑150 (MQ=255) gCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTc < 1:1328001/150‑1 (MQ=255) cc‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCg < 1:1180363/150‑1 (MQ=255) gACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGt < 2:1592654/150‑1 (MQ=255) acGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCAt > 1:419100/1‑150 (MQ=255) acGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCAt > 1:266922/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTc > 1:1889711/1‑115 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTc < 2:1889711/115‑1 (MQ=255) ggCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGa > 2:1757122/1‑150 (MQ=255) cccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACg > 2:1804514/1‑150 (MQ=255) cccTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACg > 2:37479/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGAt > 1:1619739/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATa > 2:380087/1‑150 (MQ=255) | GCGTCGCCTGGATGCGGGTGGCGTGCTGACGCAGCCAGCGCTTGTACGGGTGGCGCGACTTCAGGCGGTTGTCGATGGCGTCGGTGTCGAGGATCTGGCCGGTTTCGGTGTCCACGGCAAGGATCTGGCC‑C‑GGGCC‑GACACGGCCCTTGGCCAGCACTTCCTCAGGCTGATAGCCCCATACG‑CCGATTTCCGAGGCGATGGTGATGTAACCATTGGTGGTGGTCACCCAGCGCGCCGGGCGTAGACCGTTACGGTCGAGCAGGCACACCGCGTGGCGGCCTTCGGTCATGACGATA > NC_002947/5796638‑5796933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |