| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 317824 = | 54 (1.100) | 6 (0.130) | 6/232 | NT | 10.6% | coding (109/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 317860 = | 51 (1.120) | coding (73/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator | |||||
AGCACCGGCAGTTCGCTGTCGCGGCCGTGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGC > NC_002947/317676‑317966 | gtggcgcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagc < 2:1133058‑M1/1‑1 (MQ=255)gtggcgcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagc > 1:1251027‑M1/150‑150 (MQ=255) gcgcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagaccagatcatccgggaggacgatgacccccacctgcgccaagCCtt < 2:851393‑M1/4‑1 (MQ=255) cgcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTg < 2:335161‑M1/5‑1 (MQ=255) gcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGa < 2:709177‑M1/6‑1 (MQ=255) gcaatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGa < 1:957667‑M1/6‑1 (MQ=255) ggCAGTTCGCTGTCGCGGCCGTGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGc < 2:507358/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCGCTGTCGCGGCCGTGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGcc > 1:968738/1‑150 (MQ=255) aatgctgactctccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGc > 1:709177‑M1/143‑150 (MQ=255) tccagctgcgggtggccgcatctggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGgta < 1:983279‑M1/19‑2 (MQ=255) ccGTGCAGTTGTCCCAGCATCTGCACGCCGTCGATGCCTGGCATGCTAAGGTCGCTCTCCACCACGCCGGGTCAGTTGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTc < 1:385067/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCGGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCt > 1:1042092/1‑150 (MQ=255) tGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGACTGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGTCTTGATAC‑GCCCGGAAAGCATTTAAGGGGCAGGCTGCTCGGCTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTgg < 1:665891/150‑1 (MQ=255) tGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTgg < 1:387263/150‑1 (MQ=255) ttgttCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCaa < 1:267602/150‑1 (MQ=255) gCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGgc > 1:1155760/1‑150 (MQ=255) ggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTACAGGGTCTGGCTCACGGCTTGgc > 2:983279‑M1/109‑150 (MQ=255) aCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCa < 2:968738/150‑1 (MQ=255) gCCATCGATGCCCGGCATGCGACAGCACCTTGCCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTgggg > 1:33045/1‑150 (MQ=255) gCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTgggg > 1:421317/1‑150 (MQ=255) ccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGTCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCt < 2:217927‑M1/38‑1 (MQ=255) ccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGTCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCt > 1:217927‑M1/96‑133 (MQ=255) ccGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTcca < 2:10220/150‑1 (MQ=255) cGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTc < 2:656681/105‑1 (MQ=255) cGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTc > 1:656681/1‑105 (MQ=255) cATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGAC‑CCACACTGGATGGTAAGCTCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg < 2:33045/150‑1 (MQ=255) aTGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAgg < 1:1156113/150‑1 (MQ=255) ctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGc < 2:1180929‑M1/8‑1 (MQ=255) ctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGc > 1:1180929‑M1/80‑87 (MQ=255) aaTGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGAc > 1:335161/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGACCACCACGCCTGGCCAGTCGGCCTAGATAC‑GCTCCACCACGCAATGGTGTTCGCCCCGGTGCACTACCGGGAGCG‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGTTCCAGGTTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTg < 2:1108831/150‑1 (MQ=255) tGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTc > 2:1083894/1‑150 (MQ=255) accaccACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCgg < 2:1155760/150‑1 (MQ=255) accgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAg < 1:965283‑M1/42‑1 (MQ=255) accgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAg > 2:965283‑M1/68‑109 (MQ=255) caccacGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCt > 1:856202/1‑150 (MQ=255) cacGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTc > 2:556119/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAgt < 1:371892/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGtc > 1:1133058/1‑150 (MQ=255) cctggCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCGGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCtt < 2:1239783/86‑1 (MQ=255) cctggCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCGGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCtt > 1:1239783/4‑89 (MQ=255) tCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCg < 1:1083894/150‑1 (MQ=255) tggcTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGATAAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCggt > 1:1149627/4‑150 (MQ=255) ccTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCt < 2:443530/120‑1 (MQ=255) ccTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCt > 1:443530/1‑120 (MQ=255) cTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGACTCGGCGGTCGATCAGTGTCTCggtggt > 1:597/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGTGTCGGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCGTGCCGa > 2:113813/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGTTTTACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa > 1:1103585/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa < 2:421317/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa > 1:759436/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCGGGCCTTGTGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCGCCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg < 2:601703/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg < 2:1042092/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa < 2:425258/127‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa > 1:425258/1‑127 (MQ=255) gCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt > 1:1235714/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATc > 2:706028/1‑88 (MQ=255) ccAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATc < 1:706028/88‑1 (MQ=255) cTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGa > 1:198249/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATCCCGACGGTTCCTCCGa > 2:243331/1‑150 (MQ=255) ttGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAt > 2:1282102/1‑114 (MQ=255) ttGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAt < 1:1282102/114‑1 (MQ=255) ggCGTCGGCCATTGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTg < 2:198249/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCAGCGGGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCGGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAGCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTgg < 2:1145286/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTggg < 2:1235714/150‑1 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa < 2:498375/103‑1 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa > 1:498375/1‑103 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAg > 1:793977/1‑150 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAg < 2:948183/150‑1 (MQ=255) gcgACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCGCGGCGACGTTTCAACAGAATTGGGCAAAGTAgcgc > 2:165790/1‑150 (MQ=255) gACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt > 2:56457/1‑124 (MQ=255) gACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt < 1:56457/124‑1 (MQ=255) CCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTc > 2:1039392‑M1/1‑61 (MQ=255) CCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTc < 1:1039392‑M1/61‑1 (MQ=255) CCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg < 2:616669‑M1/67‑1 (MQ=255) CCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg > 1:616669‑M1/1‑67 (MQ=255) | AGCACCGGCAGTTCGCTGTCGCGGCCGTGCAGTTGTTCCAGCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCC‑‑‑‑‑‑‑CGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGC > NC_002947/317676‑317966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |