| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 317824 = | 54 (1.100) | 6 (0.130) | 6/232 | NT | 10.6% | coding (109/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 317860 = | 51 (1.120) | coding (73/1407 nt) | dctD‑I | C4‑dicarboxylate transport transcriptional regulator | |||||
GCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTGCGCCAC > NC_002947/317716‑318008 | gCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGgc > 1:1155760/1‑150 (MQ=255) ggcgctactttgcccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCCCGGCCAGGTACAGGGTCTGGCTCACGGCTTGgc > 2:983279‑M1/109‑150 (MQ=255) aCTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCa < 2:968738/150‑1 (MQ=255) gCCATCGATGCCCGGCATGCGACAGCACCTTGCCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTgggg > 1:33045/1‑150 (MQ=255) gCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTgggg > 1:421317/1‑150 (MQ=255) ccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCCCGGTCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCt < 2:217927‑M1/38‑1 (MQ=255) ccaattcggaggacccctcggcatgaccaccgagacactgatcgacagccgagcccaggtcatcctggtggacgatgacccccacctgcgccaagCCTTGAGCCCGGTCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCt > 1:217927‑M1/96‑133 (MQ=255) ccGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTcca < 2:10220/150‑1 (MQ=255) cATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGAC‑CCACACTGGATGGTAAGCTCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg < 2:33045/150‑1 (MQ=255) aTGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAgg < 1:1156113/150‑1 (MQ=255) aaTGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGAc > 1:335161/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGACCACCACGCCTGGCCAGTCGGCCTAGATAC‑GCTCCACCACGCAATGGTGTTCGCCCCGGTGCACTACCGGGAGCGCGGCCAGTTCCAGGTTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTg < 2:1108831/150‑1 (MQ=255) tGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTc > 2:1083894/1‑150 (MQ=255) accaccACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCgg < 2:1155760/150‑1 (MQ=255) caccacGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCt > 1:856202/1‑150 (MQ=255) cacGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTc > 2:556119/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAgt < 1:371892/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGtc > 1:1133058/1‑150 (MQ=255) cctggCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCGGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCtt < 2:1239783/86‑1 (MQ=255) cctggCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCGGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCtt > 1:1239783/4‑89 (MQ=255) tCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCg < 1:1083894/150‑1 (MQ=255) tggcTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGATAAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCggt > 1:1149627/4‑150 (MQ=255) ccTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCt > 1:443530/1‑120 (MQ=255) ccTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCt < 2:443530/120‑1 (MQ=255) cTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGACTCGGCGGTCGATCAGTGTCTCggtggt > 1:597/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGTGTCGGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCGTGCCGa > 2:113813/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGTTTTACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa > 1:1103585/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa < 2:421317/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGa > 1:759436/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCGGGCCTTGTGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCGCCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg < 2:601703/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg < 2:1042092/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa < 2:425258/127‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa > 1:425258/1‑127 (MQ=255) gCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt > 1:1235714/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATc > 2:706028/1‑88 (MQ=255) ccAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATc < 1:706028/88‑1 (MQ=255) cTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGa > 1:198249/1‑150 (MQ=255) cTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATCCCGACGGTTCCTCCGa > 2:243331/1‑150 (MQ=255) ttGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAt < 1:1282102/114‑1 (MQ=255) ttGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAt > 2:1282102/1‑114 (MQ=255) ggCGTCGGCCATTGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTg < 2:198249/150‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCAGCGGGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCGGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGAGCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTgg < 2:1145286/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTggg < 2:1235714/150‑1 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa > 1:498375/1‑103 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCa < 2:498375/103‑1 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAg < 2:948183/150‑1 (MQ=255) aGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAg > 1:793977/1‑150 (MQ=255) gcgACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCGCGGCGACGTTTCAACAGAATTGGGCAAAGTAgcgc > 2:165790/1‑150 (MQ=255) gccaagccgtgagccagaccctgtacctggccgggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGcc > 2:983279‑M2/43‑150 (MQ=255) cttgagccagaccctggacctggccgggctcaaggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCggt > 2:965283‑M2/43‑109 (MQ=255) cttgagccagaccctggacctggccgggctcaaggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCggt < 1:965283‑M2/67‑1 (MQ=255) gACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt < 1:56457/124‑1 (MQ=255) gACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGt > 2:56457/1‑124 (MQ=255) agccttgagccagaccctggacctgaccgggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTgg > 1:217927‑M2/39‑133 (MQ=255) agccttgagccagaccctggacctgaccgggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTgg < 2:217927‑M2/95‑1 (MQ=255) CCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTc < 1:1039392‑M1/61‑1 (MQ=255) CCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTc > 2:1039392‑M1/1‑61 (MQ=255) CCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg > 1:616669‑M1/1‑67 (MQ=255) CCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAg < 2:616669‑M1/67‑1 (MQ=255) CTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCg < 1:648009‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAc < 1:851393‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCa > 2:291917‑M1/1‑138 (MQ=255) CCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCa < 1:291917‑M1/138‑1 (MQ=255) CCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAcc < 1:910005‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCAcc < 2:951956‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGTGGTTTCCTGCGAATTGGGCAACGTAGCGCCAGATGGGGCCAccc < 2:1056963‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAg > 2:957667/1‑150 (MQ=255) cAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGc < 2:648009/150‑1 (MQ=255) aGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAggg < 1:1103290/103‑1 (MQ=255) aGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAggg > 2:1103290/1‑103 (MQ=255) tacctggccgggctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGga < 1:983279‑M2/131‑1 (MQ=255) tCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGga > 1:99533/1‑150 (MQ=255) aGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGagag > 1:39909/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGGCTTTGTCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCa < 1:403321/150‑1 (MQ=255) gctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg > 1:1180929‑M2/9‑87 (MQ=255) gctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAg < 2:1180929‑M2/79‑1 (MQ=255) gctcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCAtt > 1:709177‑M2/9‑150 (MQ=255) tcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTgc < 2:709177‑M2/144‑1 (MQ=255) tcaaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTgc < 1:957667‑M2/144‑1 (MQ=255) caaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTgcg < 2:335161‑M2/145‑1 (MQ=255) aaggCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCTCCCGGATGATCTGGTCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTgcgc < 2:851393‑M2/146‑1 (MQ=255) gCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTGCGCCAc > 1:1251027‑M2/2‑150 (MQ=255) gCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTGCGCCAc < 2:1133058‑M2/149‑1 (MQ=255) | GCAACTGCAGGCCATCGATGCCCGGCATGCGAATGTCGCTGACCACCACGCCGGGCCAGTCGGCCTCGATAC‑GCTCGGCCAGGCCTTGGGCTTCGGCCAGCGCGACTACCTTGAGCCCGGCCAGGTCCAGGGTCTGGCTCAAGGCTTGGCGCAGGTGGGGGTCATCGTCCACCAGGATGACCTGGGCTCGGCTGTCGATCAGTGTCTCGGTGGTCATGCCGAGGGGTCCTCCGAATTGGGCAAAGTAGCGCCAGATGCGGCCACCCGCAGCTGGAGAGTCAGCATTGCGCCAC > NC_002947/317716‑318008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |