New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2303163 = | 48 (0.980) | 6 (0.140) | 5/226 | NT | 13.6% | intergenic (‑205/+90) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2303221 = | 33 (0.740) | intergenic (‑263/+32) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
GGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAG > NC_002947/2303015‑2303300 | ggAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGc < 2:947572/150‑1 (MQ=255) gAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGcc > 1:444349/1‑150 (MQ=255) gTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGGTCGCGGGCACGCCCGCTc > 1:860824/1‑150 (MQ=255) ttggcagggggaggatttgtggcgggcgattggtaccattccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTc > 2:1192522‑M1/142‑149 (MQ=255) ttggcagggggaggatttgtggcgggcgattggtaccattccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTc < 1:1192522‑M1/8‑1 (MQ=255) ggcagggggaggatttgtggcgggcgattggtaccattccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCca > 1:472316‑M1/140‑150 (MQ=255) gcagggggaggatttgtggcgggcgattggtaccattccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCcac < 1:491153‑M1/12‑1 (MQ=255) gTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 1:723954/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa > 2:658906/1‑150 (MQ=255) gtgtTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACgg < 2:606003/150‑1 (MQ=255) gtgtTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACgg > 1:965090/1‑150 (MQ=255) tttCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGgcgc > 1:978972/1‑150 (MQ=255) cccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAgg < 1:658906/150‑1 (MQ=255) cccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAgg > 1:1171554/1‑150 (MQ=255) gACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTtc > 1:556934/1‑150 (MQ=255) caGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGGTCTCGGc > 1:1153790/1‑150 (MQ=255) gATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAg < 2:938723/137‑1 (MQ=255) gATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑c < 2:444349/150‑1 (MQ=255) gATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGGGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAg > 1:938723/1‑137 (MQ=255) taccattccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑cgcg < 1:570351‑M1/42‑1 (MQ=255) ttCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGATGATTCTGAAGCATGGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGGGTTCGCGGGCACGCACGCTCCCACAGGTACGGGGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCggg > 2:172826/1‑149 (MQ=255) ttccgccagctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAg < 1:187003‑M1/47‑1 (MQ=255) cAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTg < 1:1086612/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTgg < 2:556934/150‑1 (MQ=255) ctgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCgg > 2:570351‑M1/95‑150 (MQ=255) tgagcaggtgttgctgccggcgggcgagaacggcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCggg > 2:187003‑M1/94‑150 (MQ=255) tAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCTGCGTA‑CGCGGGCAGTGGGAGCGGGCATGcc > 2:391131/1‑150 (MQ=255) aTTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTgg < 1:529204/135‑1 (MQ=255) aTTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTgg > 2:529204/1‑135 (MQ=255) cTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGCTTCTCGGCTTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCTCGaa > 1:35502/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGcc < 1:6684/140‑1 (MQ=255) gCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGcc > 2:6684/1‑140 (MQ=255) cgatctttCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCGTTGATATCGGGCATGCCCGCGAAGAGGccc < 1:998198/144‑1 (MQ=39) ttGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGc > 2:647739/1‑150 (MQ=255) 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gcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCgg < 2:1187918‑M1/56‑1 (MQ=255) gcagcttgccgccgctctatcccaagtaagtggttgcctgtgcgggcctcttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCgg > 1:1187918‑M1/62‑117 (MQ=255) tGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAg > 1:1107654/1‑134 (MQ=255) tGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAg < 2:1107654/134‑1 (MQ=255) aGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg > 2:204485/1‑82 (MQ=255) aGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg < 1:204485/82‑1 (MQ=255) gTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCa < 1:1099283/93‑1 (MQ=255) gTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCa > 2:1099283/1‑93 (MQ=255) ttCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATaga < 1:457150/150‑1 (MQ=255) gAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGc < 2:562654/116‑1 (MQ=255) gAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGc > 1:562654/1‑116 (MQ=255) tatCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCggcggc > 1:363245/1‑150 (MQ=255) tCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCaa < 2:723954/150‑1 (MQ=255) tCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCaa > 2:1193918/1‑150 (MQ=255) ttACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGc > 2:521149/1‑150 (MQ=255) gtggtAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCg < 2:1171554/150‑1 (MQ=255) tAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa < 1:67976/94‑1 (MQ=255) tAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 2:67976/1‑94 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCTCCGTGCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGgca < 1:391131/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGgca < 1:527321/150‑1 (MQ=255) gtTCGCGGGCACGCCCGCTCACACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGgcag < 2:35502/150‑1 (MQ=255) | GGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTA‑CGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAG > NC_002947/2303015‑2303300 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |