New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2981188 = | 55 (1.120) | 3 (0.070) | 3/230 | NT | 5.9% | coding (1220/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2981219 = | 45 (1.000) | coding (1189/1734 nt) | PP_2607 | hypothetical protein |
GTCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACGAAGC > NC_002947/2981046‑2981323 | gTCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCtt > 1:1036823/1‑150 (MQ=255) gTCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCtt < 1:300042/150‑1 (MQ=255) tCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCATACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTg < 2:860890/150‑1 (MQ=255) tCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTg < 1:828444/150‑1 (MQ=255) agccgggcgtgattgcggtagaccaaaccgggcggcgcttcgtcaacgagtccgactcctaccaccacttcgtgcacacaatgttcgccaaaggcattgccagctgctggctggtctgcgatgccgaggcaatgaaccgctACGGGCTTg < 2:102907‑M1/9‑1 (MQ=255) cccgggcgtgattgcggtagaccaaaccgggcggcgcttcgtcaacgagtccgactcctaccaccacttcgtgcacacaatgttcgccaaaggcattgccagctgctggctggtctgcgatgccgaggcaatgaaccgctAcgggcctga > 1:685867‑M1/141‑146 (MQ=255) gATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTggg > 2:940177/1‑150 (MQ=255) cATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTTGGCcgcg > 1:1016589/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAg < 2:944294/150‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAg > 1:514113/1‑150 (MQ=255) gTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTa < 2:574983/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCgg > 1:53952/1‑150 (MQ=255) gtgAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCa > 2:1063606/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGc > 1:1012732/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGc > 1:302157/1‑150 (MQ=255) tgtTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTTGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTc < 2:1016589/150‑1 (MQ=255) gtTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCg < 1:318891/150‑1 (MQ=255) aaaCACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTCCACGGCCTCGGCAGCGCa < 2:53952/150‑1 (MQ=255) ccTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAcca < 1:1151483/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACggg < 1:1126053/93‑1 (MQ=255) cTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACggg > 2:1126053/1‑93 (MQ=255) gtgGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAccagcc > 1:512552/1‑150 (MQ=255) tCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAcca > 1:199923/1‑142 (MQ=255) tCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAcca < 2:199923/142‑1 (MQ=255) accacttcgtgcacacaatgttcgccaaaggcattgccagctgctggctggtctgcgatgccgaggcaatgaaccgctACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGc < 2:736370‑M1/34‑1 (MQ=255) accacttcgtgcacacaatgttcgccaaaggcattgccagctgctggctggtctgcgatgccgaggcaatgaaccgctACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGc > 1:736370‑M1/79‑112 (MQ=255) aCGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTg > 1:378682/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCAGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTg > 2:736109/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAccagcca > 1:1011354/1‑141 (MQ=255) gCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAccagcca < 2:1011354/141‑1 (MQ=255) gATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCg < 2:643768/103‑1 (MQ=255) gATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCg > 1:643768/1‑103 (MQ=255) gccagggccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCt > 2:1052742/1‑150 (MQ=255) cagggccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCttt < 1:173500/150‑1 (MQ=255) gggccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTgg < 2:883917/150‑1 (MQ=255) ggccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGc < 1:17534/150‑1 (MQ=255) ccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCAtt < 1:487017/104‑1 (MQ=255) ccagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCAtt > 2:487017/1‑104 (MQ=255) cagTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCCGCTGCCAATGCCTTACGCGaa > 2:274360/1‑150 (MQ=255) cTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATtgt < 1:1063606/150‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAccagccag > 1:509/1‑117 (MQ=255) gATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGAccagccag < 2:509/117‑1 (MQ=255) ggtggCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGaa < 1:940177/150‑1 (MQ=255) ggtggCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGaa < 2:583499/150‑1 (MQ=255) gtggCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATAGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATGGTGTGCACGAAg < 2:1012732/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGAACAGGTAGCGTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAgtg < 2:1036823/150‑1 (MQ=255) cccGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGc > 2:45656/1‑91 (MQ=255) cccGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGc < 1:45656/91‑1 (MQ=255) cGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGtggtgg < 2:378682/150‑1 (MQ=255) tACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAg < 1:274360/150‑1 (MQ=255) aGGGAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGGCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAg < 1:736109/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCgcgc < 2:348773/48‑1 (MQ=255) gTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGCTCATTGCCTCGGCGTCGCCGACCAGCCGGCAGCTTGCAATGCCTTTGGCGCACCTTGTGTGCACCAGGCGGTGGTCGGAggc > 2:274658/1‑148 (MQ=255) tAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCg < 1:1052742/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACt > 1:58518/1‑150 (MQ=255) cGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGa < 2:302157/150‑1 (MQ=255) ccgaggcaatgaaccgctACGGGCTTGGCCTGGCGCGGCCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACg < 2:416514‑M1/132‑1 (MQ=255) tCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAg < 2:499053/131‑1 (MQ=255) tCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAg > 1:499053/1‑131 (MQ=255) aaCGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACGAAg < 2:514113/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACGAAgc > 1:1088534/1‑150 (MQ=255) aCGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGCCATTACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACGAAgc > 1:336607/1‑150 (MQ=255) | GTCGATGCCATTGCCGGCATCGCTGTTGAACTGTGAAAGTGTTTGCGCAAACACCTGTGGATCGACGCCGATGGCCAGGGCCAGTGCCTGCGATGTGGTGGCCCGGTACAGGTAGCCTGCGTCGATCAACGCCTGGTTGTTGACGGGCTTGGGCCGCGCCAGGCCAAGCCCGTAGCGGTTCATTGCCTCGGCATCGCAGACCAGCCAGCAGCTGGCAATGCCTTTGGCGAACATTGTGTGCACGAAGTGGTGGTAGGAGTCGGACTCGTTGACGAAGC > NC_002947/2981046‑2981323 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |