New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4240195 = | 74 (1.510) | 5 (0.110) | 4/226 | NT | 7.7% | coding (139/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4240236 = | 53 (1.200) | coding (98/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
GCGCCCGCCCCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGAT > NC_002947/4240087‑4240383 | gcgcCCGCCCCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCa > 2:1217622/1‑150 (MQ=255) cccgcccCTGGCACTCAAGGCTGCTCATCATCGACTCCCCCTGCACCAACTGGCCGCTGGCAGCAGCCACATGCTCCACCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGCCCCGGGG‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACATGCCACTGCTGCCGTCCGCCCATtg > 2:32025/1‑150 (MQ=255) gcccCTGGCACTCAAGGCTGCTACTCCTCGCCTCGGCCTTTAGCAACTTGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa < 2:1104635/150‑1 (MQ=255) gcccCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa < 2:899874/150‑1 (MQ=255) ccccTGGCACTCAAGGCTGATCATCCTCGCCTCCACCTCCTCCAACTGCCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCCTCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAg < 1:725391/150‑1 (MQ=255) ccTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAggg < 1:301575/150‑1 (MQ=255) gCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAg > 2:344152/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAg > 2:1133365/1‑146 (MQ=255) tCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAg < 1:1133365/146‑1 (MQ=255) tCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCggg > 1:1104700/1‑150 (MQ=255) tGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCGCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCGCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCgg < 2:166203/150‑1 (MQ=255) tcatcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGgag > 2:69137/1‑150 (MQ=255) ctgtgcgcgggcgtgcctggcaggctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt > 2:209388‑M1/80‑123 (MQ=255) ctgtgcgcgggcgtgcctggcaggctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt < 1:209388‑M1/44‑1 (MQ=255) tgtgcgcgggcgtgcctggcaggctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcaccatGGGCCAGGGCGCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCgg > 2:340430‑M1/79‑150 (MQ=255) atcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGcc > 2:844960/1‑150 (MQ=255) tcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCt > 1:562008/1‑150 (MQ=255) gACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTgg < 1:1217622/150‑1 (MQ=255) gACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTgg < 2:562008/150‑1 (MQ=255) cTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATtgt < 2:778108/117‑1 (MQ=255) cTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATtgt > 1:778108/1‑117 (MQ=255) tCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTc > 1:1270122/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGCGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGcc > 1:413031/1‑150 (MQ=255) ccAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCGACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCa < 2:147524/150‑1 (MQ=255) ccAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCa > 1:411213/1‑150 (MQ=255) ccAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCa < 2:413031/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGcc < 2:623262/144‑1 (MQ=255) cAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGcc > 1:623262/1‑144 (MQ=255) gctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt > 2:1176088‑M1/57‑100 (MQ=255) gctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt < 1:1176088‑M1/44‑1 (MQ=255) tGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTa > 2:3445/1‑150 (MQ=255) ggCCGATGGCAGCGGCCACATACGCCAGCGCCTCGTGGGTTTCACCATGGGCCACGCC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGGCACGCGCCCCTGCTGCCGCGCGCCCATTGGGAGGGGAAGCGGAGTATCGGGAGAGTCCTGGGTCATGCCCTGCAGTCTAg < 2:404663/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc < 2:901117/150‑1 (MQ=255) cGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCt > 1:632022/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGTGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCa < 1:361194/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCa < 1:3445/150‑1 (MQ=255) ccACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGcc < 1:69137/150‑1 (MQ=255) cacaTACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGccc > 2:528301/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATg > 2:1150164/1‑114 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATg < 1:1150164/114‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc < 2:393155/128‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc > 1:393155/1‑128 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca < 1:528301/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca < 2:291002/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca < 2:15169/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGcc < 1:722424/150‑1 (MQ=255) ccgataccccgcttaccctcacaatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgccctggcccATGGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGcaca > 2:340430‑M2/73‑150 (MQ=255) ccTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCttt < 2:632022/150‑1 (MQ=255) cTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTg > 1:892748/1‑150 (MQ=255) cTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTg < 1:844960/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg > 1:298935/1‑80 (MQ=255) tCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg < 2:298935/80‑1 (MQ=255) ggTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAg < 2:1104700/150‑1 (MQ=255) ccATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATc < 2:892748/150‑1 (MQ=255) cATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTggg > 1:412864/1‑87 (MQ=255) cATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTggg < 2:412864/87‑1 (MQ=255) cATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCg > 1:202391/1‑150 (MQ=255) aTGGGCCAGCGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGGGCCACTGCTGCAGCGCGCACATCGTAAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTAGGTCATGCCCGGCAGCCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCgg < 1:32025/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCt < 1:277690/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCCGGTTCATCGGCCtt > 2:69023/1‑150 (MQ=255) ccAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCAt < 2:73677/85‑1 (MQ=255) ccAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCAt > 1:73677/1‑85 (MQ=255) aatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc > 2:1176088‑M2/45‑100 (MQ=255) aatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc < 1:1176088‑M2/56‑1 (MQ=255) aatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAg < 1:209388‑M2/79‑1 (MQ=255) aatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAg > 2:209388‑M2/45‑123 (MQ=255) GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAgg > 1:435297‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCaa > 2:411213‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCaa < 2:1113662‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGt < 2:1270122/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:1050111/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGACGGTAAGCGCGGTATCGGGAGAGGCCTCGGTCATGCCCGGCAGCCTAGCCTCCCCGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACGGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 2:1219670/1‑150 (MQ=255) gctgcAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgc < 2:1050111/150‑1 (MQ=255) tgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCgg > 1:1252014‑M2/13‑150 (MQ=255) gcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCg < 2:46938‑M2/100‑1 (MQ=255) gcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCg > 1:46938‑M2/9‑108 (MQ=255) gcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg < 1:244916‑M2/137‑1 (MQ=255) gcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg > 2:244916‑M2/5‑141 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCa > 1:402155‑M2/3‑93 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCa < 2:402155‑M2/91‑1 (MQ=255) ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAatgat > 1:1031494‑M2/3‑150 (MQ=255) | GCGCCCGCCCCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGC‑‑‑‑‑‑GCGCTGCAACGCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGAT > NC_002947/4240087‑4240383 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |