New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1367887 = | 81 (0.710) | 7 (0.060) | 6/230 | NT | 8.7% | coding (313/603 nt) | PP_1193 | membrane protein |
? | NC_002947 | 1367919 = | 70 (0.650) | coding (345/603 nt) | PP_1193 | membrane protein |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTG > NC_002947/1367739‑1368036 | caccaccaacatgattgccgtgatcatcgccaggcttaccgccgacatgattaccatgatcatccccgggttccccacccacgtgattgccatgatcgtcacccgcttcagcatggttgctgctgcgcccagcgtttgaattaccgtcgt > 1:2182546‑M1/149‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACggtggt < 2:1376786/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGTAGCGGCGGTGACGgtggtg > 1:2710287/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGgtggtg < 1:827590/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGgtggtg < 1:1379853/150‑1 (MQ=255) ggcgggggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCAt < 2:1705638/144‑1 (MQ=255) ggtggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCGACGGTGGGGGGGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGcc < 1:3041997/150‑1 (MQ=255) ggtggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCTCGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGTGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGCGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGcc < 1:2040167/150‑1 (MQ=255) ggtggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCGTGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCAGTGACGATGATGGCCATGcc > 2:252312/1‑150 (MQ=255) ggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGc > 1:261021/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCa > 2:2266351/1‑150 (MQ=255) aaGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGTAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCaa < 2:2710287/150‑1 (MQ=255) ccACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTg > 1:1584362/1‑143 (MQ=255) ccACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTg < 2:1584362/143‑1 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCGGCGGCGGTGACGTTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCgacgac > 1:222402/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGTTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 2:308172/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 1:623437/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGAGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 1:1936109/1‑150 (MQ=255) 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1:2742709/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCgg < 1:1806613/136‑1 (MQ=255) aCGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCgg > 2:1806613/1‑136 (MQ=255) cGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTaa < 1:235449/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAAt < 2:1383523/150‑1 (MQ=255) cggcggTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGt < 1:736552/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGgc < 2:2657273/60‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |