New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1367887 = | 81 (0.710) | 7 (0.060) | 6/230 | NT | 8.7% | coding (313/603 nt) | PP_1193 | membrane protein |
? | NC_002947 | 1367919 = | 70 (0.650) | coding (345/603 nt) | PP_1193 | membrane protein |
CACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAA > NC_002947/1367772‑1368068 | cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCGGCGGCGGTGACGTTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCgacgac > 1:222402/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGTTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 2:308172/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 1:623437/1‑150 (MQ=255) cACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGAGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgac > 1:1936109/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCacgacg > 2:736552/1‑150 (MQ=255) tggtggcggtggcggtggcggtggcGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACgg < 1:251953/149‑1 (MQ=37) cGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACgg < 2:680025/150‑1 (MQ=255) cgccgacatgattcacatgatcctccacgggttccccactcacgtgattgccatgatcgtcacccgcttcagcatggttgctgctgcgcccagcgtttgaattaccgtcGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAAt > 2:160177‑M1/110‑150 (MQ=255) gtggtggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAAtt > 1:1457451/1‑150 (MQ=255) gtggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCaa < 1:2805116/150‑1 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGTTGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCaaa > 2:1583081/1‑150 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCTGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCaaa > 1:1339154/1‑150 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCaaa < 1:1027755/150‑1 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGCGGCCACGGTGGGGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCaaa > 1:1250678/1‑150 (MQ=255) ggAAGTGGCGGTGGTGGTGGCAACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCGGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAAc < 2:905544/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGCTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACg > 1:2251741/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGAAGGCGGAGGTAACTAGGGTGGCGGAAGCGGAATTTTTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAGCAGCGGCAGTGCCCGCGACGGTAATTAAAACg > 1:536471/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCt > 1:1019871/1‑150 (MQ=255) 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1:2856461/1‑122 (MQ=255) tggAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCGGCAACCATGCTGAAGCggg > 1:1155430/1‑150 (MQ=255) tggAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCggg < 2:1936109/150‑1 (MQ=255) gAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTg > 2:2896693/1‑150 (MQ=255) aaGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGa < 1:624449/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCAt < 2:2251741/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gccactgccgctgttgccggcatggccacGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATgg > 1:2037085‑M2/30‑124 (MQ=255) ccactgccgctgttgccggcatggccacGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATc > 2:1182772‑M2/29‑92 (MQ=255) ccactgccgctgttgccggcatggccacGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATc < 1:1182772‑M2/64‑1 (MQ=255) ccactgccgctgttgccggcatggccacGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACgtgggtgg < 1:207346‑M2/74‑1 (MQ=255) ccactgccgctgttgccggcatggccacGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACgtgggtgg > 2:207346‑M2/29‑102 (MQ=255) CCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGa > 1:366753‑M1/1‑150 (MQ=255) CATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACACGGTTATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGAt < 1:2336517‑M1/150‑1 (MQ=255) ATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATg < 1:2998239‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACgtgggtgg < 1:2502509/99‑1 (MQ=255) tGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACgtgggtgg > 2:2502509/1‑99 (MQ=255) cGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCa > 1:2841817/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAGTGGCCACGACAGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAAACATGCTGAAACGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAAACCGGGGATGACCATAGTAATCATATCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCaca > 2:634557/1‑148 (MQ=255) cGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCa > 1:2039748/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCa < 1:308172/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCAt < 2:2998239/150‑1 (MQ=255) acGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAAt < 2:2791790‑M2/99‑1 (MQ=255) acGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAAt > 1:2791790‑M2/3‑101 (MQ=255) acGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGgtggtg > 1:2182546‑M2/3‑150 (MQ=255) gacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGaa > 1:2246699/1‑150 (MQ=255) | CACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAA > NC_002947/1367772‑1368068 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |