| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 2280773 | 97 (0.850) | 6 (0.050) | 5/236 | NT | 5.8% | coding (1870/2082 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase |
| ? | NC_002947 | = 2280792 | 100 (0.900) | coding (1889/2082 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTG > NC_002947/2280624‑2280922 | gcgcGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACGGTCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGc < 2:875116/150‑1 (MQ=255) cgcgGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGcc < 1:2909570/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGc < 1:731108/150‑1 (MQ=255) gtgtACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCAGAtt > 2:2757583/1‑150 (MQ=255) tgccTGTTGCAGCGTAAGAGATCCAAGGCGAGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGTTTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCGGATGCTCAACAGTTTCGAGTATATGGGTATCGACGGTGCCGGCCTGCACATTCgt < 2:160999/148‑1 (MQ=255) cAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggc < 2:1100849‑M2/150‑5 (MQ=255) gcgcAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcgg > 2:192505/1‑150 (MQ=255) atgcAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCCCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCATATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCa < 2:565213/147‑1 (MQ=255) aTCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCa > 2:434550/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgtgt > 2:939001/1‑128 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGCCGGCGGCGAGCCCCAGGTg > 1:158132/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGGTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTg > 2:553390/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCCCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgtgt < 1:939001/128‑1 (MQ=255) ggTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCt < 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2:2330070/1‑150 (MQ=255) tCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCgg > 1:1557598/1‑150 (MQ=255) gAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcggcgagccccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgttcttcaacccggtgcggtgaatccagccggtcgtcttgccgagccc < 1:2378713‑M2/141‑98 (MQ=255) gAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcggcgagccccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgttcttcaacccggtgcggtgaatccagccggtcgtcttgccgagccc > 2:2378713‑M2/1‑44 (MQ=255) gAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGATCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGGCGGTg > 1:929052/1‑150 (MQ=255) gAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTg > 1:803568/1‑150 (MQ=255) gAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTg > 1:1987172/1‑150 (MQ=255) gggTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGAt < 1:1553390/150‑1 (MQ=255) ggTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATc < 2:382502/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcatcgtcgatacccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgttctt > 2:1916368‑M2/1‑31 (MQ=255) tCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcatcgtcgatacccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgttctt < 1:1916368‑M2/89‑59 (MQ=255) tCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcatcgtcgatacccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgtt < 1:1161538‑M2/86‑56 (MQ=255) tCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATcggcg > 2:2604132/1‑150 (MQ=255) gacgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg < 2:419748/124‑1 (MQ=255) gacgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg > 1:419748/1‑124 (MQ=255) cgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGgcgc < 2:2043910/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg > 2:631486/1‑119 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg < 1:631486/119‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGa > 1:212648/1‑150 (MQ=255) gCCGtccacacgaatgtgcaggccggcatcgtcgatacccagatactcgacactgttgagcatctgcacccccttgttcttcaacccggtgcggtgaatccagccggtcgtcttgccgagcccgtcgcccaccttggatttcttgcgctg < 2:1100849‑M1/150‑147 (MQ=255) cGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGAtgt > 2:450611/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGAtgt > 1:2136189/1‑150 (MQ=255) | CGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTG > NC_002947/2280624‑2280922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |