| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2280773 | 97 (0.850) | 6 (0.050) | 5/236 | NT | 5.8% | coding (1870/2082 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase |
| ? | NC_002947 | = 2280792 | 100 (0.900) | coding (1889/2082 nt) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCGAGCTGGATGC > NC_002947/2280643‑2280939 | gTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGa < 2:508506/150‑1 (MQ=255) cAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggc < 2:1100849‑M2/150‑5 (MQ=255) gcgcAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGAcggcgg > 2:192505/1‑150 (MQ=255) atgcAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCCCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCATATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCa < 2:565213/147‑1 (MQ=255) aTCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCa > 2:434550/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGCCGGCGGCGAGCCCCAGGTg > 1:158132/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGGTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTg > 2:553390/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGAACGGCTGGATTCACCGCGCCGGGTTGAAGAACAAGGGGCTGTCTTTCCGTAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCt < 1:1301519/150‑1 (MQ=255) aCGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTgg > 2:1662959/1‑144 (MQ=255) aCGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTgg < 1:1662959/144‑1 (MQ=255) aCGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTgg < 2:2182123/150‑1 (MQ=255) cGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGa < 1:2104470/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGACGACCGTCTGGATTCACCGCATCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACgt < 1:168304/150‑1 (MQ=255) ggCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCACATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGCGGACGGCGGCGAGCCCCATGTGCTGGCGGTGGATAACgtg < 1:2927203/150‑1 (MQ=255) cAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACgtggt < 2:158132/150‑1 (MQ=255) aaGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACgtggtg > 2:2592436/1‑150 (MQ=255) aggcgacCGGTTGGATGCACCGCACGGGGTTGAAGAACGGGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGa < 1:27684/147‑1 (MQ=255) gacgacCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGAGGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGTTGGATAACGTGGTGAt > 1:2831612/1‑150 (MQ=255) 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tCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATcggcg > 2:2604132/1‑150 (MQ=255) gacgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg > 1:419748/1‑124 (MQ=255) gacgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg < 2:419748/124‑1 (MQ=255) cgaTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGgcgc < 2:2043910/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCgg > 2:1898448/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg < 1:631486/119‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg > 2:631486/1‑119 (MQ=255) tGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGa > 1:212648/1‑150 (MQ=255) gCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTgg < 1:434550/150‑1 (MQ=255) tGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGATGTGCGGGGTGGCGGACAGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGAGGTggcgg > 1:2664589/1‑150 (MQ=255) cacaTTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGcc > 2:2998254/1‑150 (MQ=255) acaTTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGct < 2:117542/112‑2 (MQ=255) acaTTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGct > 1:117542/1‑111 (MQ=255) acaTTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCg > 2:282074/1‑150 (MQ=255) cGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCGAGCTg < 1:2757583/150‑1 (MQ=255) gttgACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCGAGCTGGAt < 1:2604132/147‑1 (MQ=255) ggACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATGACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCGAGCTGGATGc < 1:2330070/150‑1 (MQ=255) gACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCAc > 2:2643626/1‑111 (MQ=255) gACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCAc < 1:2643626/111‑1 (MQ=255) | GTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCGGTGCACCTGATCGGCGGCGCGGATGTGGCGGCCGAGCTGGATGC > NC_002947/2280643‑2280939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |