| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GCATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGC > NC_002947/2887447‑2887743 | gcATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAgg > 1:1761483/1‑150 (MQ=255) cATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGgc > 1:882734/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGgcg > 2:23016/1‑150 (MQ=255) 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gCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGa > 1:4435/1‑147 (MQ=255) gCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGAGCGTCGCGCAGTCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGt > 2:2688314/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGc < 2:1888915/150‑1 (MQ=255) cgcgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCCACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTt > 2:1276347‑M2/1‑149 (MQ=255) gcgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtg < 1:1154665‑M2/150‑3 (MQ=255) 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1:2327137‑M2/1‑23 (MQ=255) cTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttca < 2:2327137‑M2/95‑73 (MQ=255) tGGCGCAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagt > 1:784735‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtg < 2:3063367‑M2/150‑130 (MQ=255) gcgcAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgtt < 2:163020‑M1/90‑86 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAg < 1:617528/102‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCACCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGAc > 1:1317226/1‑150 (MQ=255) gcAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccg > 1:23016‑M1/1‑3 (MQ=255) gcAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccg > 1:1767243‑M1/1‑3 (MQ=255) gcAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggac > 2:799805‑M1/1‑3 (MQ=255) gcAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaatt < 2:2885708‑M1/85‑83 (MQ=255) cAagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccgc < 1:1154665‑M1/150‑149 (MQ=255) cAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccgc > 1:3063367‑M2/1‑17 (MQ=255) aagcacctcaagcgcctgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagtgggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccgcg > 2:1276347‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCATCGTCCAGCAACGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGCTGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGC > NC_002947/2887447‑2887743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |