| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2887594 | 87 (0.760) | 9 (0.090) | 9/220 | NT | 10.1% | coding (1118/1425 nt) | PP_2542 | GntR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 2887609 | 82 (0.790) | coding (1103/1425 nt) | PP_2542 | GntR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGTTGGGCGAAA > NC_002947/2887461‑2887756 | gcgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtg < 1:1154665‑M2/150‑3 (MQ=255) cgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgc > 2:2634320‑M2/1‑147 (MQ=255) cgGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgc > 1:1767243‑M2/1‑147 (MQ=255) aCTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgcca > 1:784735‑M2/1‑143 (MQ=255) gTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcg < 1:1526655‑M2/150‑11 (MQ=255) gTCGGGAATATCCGGATGGCGTGTCTAGATGTACATCCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcg > 2:19606‑M2/1‑140 (MQ=255) gggAATCGCCGGATGGCGGGCCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGccc < 1:2001465/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATc < 1:2615827/150‑1 (MQ=255) ggTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATa < 1:1967252/150‑1 (MQ=255) gTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgc > 2:799805‑M2/1‑118 (MQ=255) gTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgc < 1:799805‑M2/121‑4 (MQ=255) tCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATaca < 1:1683985/150‑1 (MQ=255) tCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGAAttga < 1:2410719/150‑4 (MQ=255) aGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATAcacca > 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ttCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCt < 2:2070113/143‑1 (MQ=255) ttCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCt > 1:2070113/1‑143 (MQ=255) ttCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCAc > 2:404711/1‑150 (MQ=255) tCATCCGATTCGGTGAACAATGCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCAcc < 1:2177688/150‑1 (MQ=255) tacGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGc > 2:2054427/3‑150 (MQ=255) tCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGc > 1:2834971/1‑150 (MQ=255) tCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCCGc < 1:3063447/150‑1 (MQ=255) tGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAggtggt > 2:1720059/1‑148 (MQ=255) tGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAggtggt < 1:1720059/148‑1 (MQ=255) tGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCa > 1:528707/1‑150 (MQ=255) tGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCa < 1:155444/150‑1 (MQ=255) gAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAg < 2:1526655/150‑1 (MQ=255) gAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAg > 2:1939726/1‑150 (MQ=255) gAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAg > 1:1165205/1‑150 (MQ=255) aaCAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgc < 2:163020‑M2/90‑6 (MQ=255) aaCAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgc > 1:163020‑M2/1‑85 (MQ=255) 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ttCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCa < 2:1795000/143‑1 (MQ=255) ttCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGa < 2:1050687/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAgcg > 1:2878997/1‑150 (MQ=255) gCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCgatgat < 1:985627/96‑1 (MQ=255) cccAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATc > 2:1366284/1‑150 (MQ=255) cccAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATc < 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ggCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGGGGCCGACTGCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGttttt > 1:1725165/1‑150 (MQ=255) ggCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGttttt < 1:2054427/150‑1 (MQ=255) gCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCGTCTTCAg > 1:2696505/1‑135 (MQ=255) gCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCGTCTTCAg < 2:2696505/135‑1 (MQ=255) gCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTg < 2:2834971/150‑1 (MQ=255) 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cTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAggtg > 1:306381/1‑94 (MQ=255) gCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTg < 1:1900332/144‑1 (MQ=255) gCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTg > 2:1900332/1‑144 (MQ=255) gCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGc < 2:834825/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCa < 1:1939726/150‑1 (MQ=255) gc‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggacgaggaggatcaggaagttggccggcatctgcagcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgaca < 1:837628‑M2/150‑127 (MQ=255) c‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttca < 2:2327137‑M2/95‑73 (MQ=255) c‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttca > 1:2327137‑M2/1‑23 (MQ=255) ggCGCAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtg < 2:3063367‑M2/150‑130 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggc > 1:2142229‑M2/1‑20 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCGGCATACACCACGCGCTCCATAAACTGGGCGGTGGTTAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCCATCTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCCTGTAGCAGAc > 1:25405/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAg < 1:617528/102‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAg > 2:617528/1‑102 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCACCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGAc > 1:1317226/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTTGAGGTGCTtgcgccagcgcctggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccggcgattcccgacagtgccgc > 1:3063367‑M2/1‑17 (MQ=255) aGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGc < 2:1165205/150‑1 (MQ=255) gcTTGAGGTGCTtgcgccagcgcccggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccgg > 2:673207‑M2/1‑12 (MQ=255) gcTTGAGGTGCTtgcgccagcgcccggccgaggcgcatcaggaagttggccggcatctgcatcgactgggctttgaattgttcaccgaatcggatgaaggcatgtacatctggacccgccatccgg < 1:673207‑M2/126‑115 (MQ=255) gcTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGt > 2:1145069/1‑150 (MQ=255) ttGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACg > 2:559055/1‑147 (MQ=255) ttGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACg < 1:559055/147‑1 (MQ=255) ttGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGTTg < 2:2779434/150‑1 (MQ=255) gTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGTTGGGCGa > 2:693203/1‑150 (MQ=255) tGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGc > 1:1748806/1‑130 (MQ=255) gCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGTTGGGCGaaa > 2:1726568/1‑150 (MQ=255) gCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGAATACAGCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGc > 1:2688489/1‑69 (MQ=255) gCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGAATACAGCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGc < 2:2688489/69‑1 (MQ=255) | CGCGGCACTGTCGGGAATCGCCGGATGGCGGGTCCAGATGTACATGCCTTCATCCGATTCGGTGAACAATTCAAAGCCCAGTCGATGCAGATGCCGGCCAACTTCCTGATGCGCCTCGGCCAGGCGC‑TGGCGCAGGCGCTTGAGGTGCTTGCGCCAGCGCCCGTCGATGATCGCCGCATACACCACGCGCTCCATCACCTGCGAGGTGGTCAGGCCTGAGCGCATCTTCAGGTGCAGCAGTTTTTGCATCAGTTCGGGGTTGGCCAGCATGTAGCCGACCCGCACGTTGGGCGAAA > NC_002947/2887461‑2887756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |