New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3142930 = | 97 (0.850) | 6 (0.060) | 6/224 | NT | 6.9% | coding (836/1029 nt) | PP_2758 | ribose ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 3142976 = | 72 (0.690) | coding (882/1029 nt) | PP_2758 | ribose ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCAC > NC_002947/3142781‑3143077 | cTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAAtt < 2:1235001/150‑1 (MQ=255) tcatgcgtcgcctcggatgcgtttgacgtcatcgacgttgcccggcgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtcgcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggctg < 1:2655597‑M1/2‑1 (MQ=255) tcatgcgtcgcctcggatgcgtttgacgtcatcgacgttgcccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggctg < 2:538117‑M1/2‑1 (MQ=255) tCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgctgc > 2:2861232/1‑150 (MQ=255) tCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGACGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATtgctgc > 2:1776254/1‑150 (MQ=255) gtcgcctcggatgcgtttgacgtcatcgacgttgcccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatagtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttattcacctccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTgcgc > 2:2762495‑M1/143‑150 (MQ=255) tcgcctcggatgcgtttgacgtcatcgacgttgcccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTGCGcc < 2:2361597‑M1/9‑1 (MQ=255) cgcctcggatgcgtttgacgtcatcgacgttacccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgccacgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTGCGCca > 1:244254‑M1/141‑150 (MQ=255) gTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcc > 2:1127564/1‑150 (MQ=255) ccccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccgg > 1:1919113/1‑150 (MQ=255) cccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggc > 2:2532696/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggca < 1:1323125/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggca < 1:2307573/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggca > 1:1814297/1‑150 (MQ=255) cAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCAGCATGAAATGAGGTGCGCACCTATGGCTTCGACGGTACGACCGAGGTGCTGGGCTTGCCGCGCgagcccggcag > 1:2361597/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCcagcccggcagcccg < 2:1589490/150‑1 (MQ=255) gAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTg < 2:867553/150‑1 (MQ=255) gtcatcgacgttgcccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTgcgc < 2:276616‑M1/8‑1 (MQ=255) gtcatcgacgttgcccgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTgcgc > 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aCGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTgg < 2:552162/144‑1 (MQ=255) gcgATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAgtg < 1:1645330/150‑1 (MQ=255) aTCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAgtggtg < 1:2102316/150‑1 (MQ=255) ggcggcCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCGAGCCAGGCGGTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATTGCGTCGACGGTACGCCCGAGCGGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCGGGTGGCTGCAGTGGTGGCgca > 1:2474872/1‑150 (MQ=255) cgccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCgcag > 2:2949261‑M1/107‑150 (MQ=255) ccgtggtcagcagggtctcgacgaaggtttcgggcggcagatcgtgctcgccggccaggtagcgggcgacgttatgcaccgccgtacggccgatcaacgcaggcTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCgcagca > 1:965690‑M1/105‑150 (MQ=255) ccTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGt > 1:2760407/1‑127 (MQ=255) tGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGt > 1:1121481/1‑125 (MQ=255) tGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGt < 2:1121481/125‑1 (MQ=255) tGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCt > 1:96016/1‑150 (MQ=255) tGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCt > 1:139161/1‑150 (MQ=255) 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cGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCtt > 2:749786/1‑150 (MQ=255) ggTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtc < 2:2078636/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtcgtc < 2:1919113/150‑1 (MQ=255) gCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCga < 1:1424341/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtcgtcgccg > 2:848797/1‑147 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga < 2:1729474/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga < 1:2746883/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCTGGAAGTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCgaga < 1:1656638/150‑1 (MQ=255) gAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGCTGGCGGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGAcc > 2:2655597/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCctg < 1:2861232/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCATTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGAt < 1:2063909/119‑1 (MQ=255) tGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGAt > 2:2063909/1‑119 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa > 1:1649149/1‑150 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa < 1:1824014/150‑1 (MQ=255) tGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa < 2:65973/150‑1 (MQ=255) ggAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtcgt > 1:1517100/1‑135 (MQ=255) ggAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTtcgt < 2:1517100/135‑1 (MQ=255) aaTTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCa < 1:557422/150‑1 (MQ=255) | CTTGCTCAACAAGTACCCCAAAGGTGAGCTCGACGCGATCTGGGCGGCCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCAC > NC_002947/3142781‑3143077 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |