New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 3142976 = | 72 (0.690) | coding (882/1029 nt) | PP_2758 | ribose ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGA > NC_002947/3142828‑3143123 | ccTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCagcagc > 2:2265263/1‑150 (MQ=255) cTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGcc > 1:1331557/1‑150 (MQ=255) tGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCt < 1:2265263/150‑1 (MQ=255) 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aTCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGt < 1:906052/150‑1 (MQ=255) tCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGCACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCACCGCGGCAGCCCGGCGGCTGCAGCGGTCGCGCAGCAGACTGCGtt > 2:557422/1‑150 (MQ=37) tGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGa < 2:2998352/150‑1 (MQ=255) tGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGAAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTAGAATTTCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTAGCTGCAGTGGGGGGGCAGCAGCCTGGGTTGa > 1:1239067/1‑150 (MQ=38) gCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCgg > 1:1757680/1‑150 (MQ=255) 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tGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGAc > 1:634185/1‑143 (MQ=255) tGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGAc < 2:634185/143‑1 (MQ=255) gCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTgc < 1:1981458/88‑1 (MQ=255) gCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTgc > 2:1981458/1‑88 (MQ=255) tGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa < 1:589044/116‑1 (MQ=255) tGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGa > 2:589044/1‑116 (MQ=255) tGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCac > 1:954567/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATcc > 2:812087/1‑150 (MQ=255) gtggtgGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGa > 1:349647/1‑150 (MQ=255) gtggCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGc < 1:812087/150‑1 (MQ=255) tggcgcagcaGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGTGGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGTAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCg > 1:244254‑M2/11‑150 (MQ=255) ggcgcagcaGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGa < 2:2361597‑M2/141‑1 (MQ=255) gcgcagcaGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGAc < 2:276616‑M2/121‑1 (MQ=255) caGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGa < 1:1637903‑M2/148‑1 (MQ=255) caGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGa < 2:617510‑M2/148‑1 (MQ=255) caGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGa < 2:538117‑M2/148‑1 (MQ=255) caGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCGACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGCCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGa < 1:2655597‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCTGGGATCTGCCGCAGCTCGGTGCCAGCCAGGCGCTGATCGAAGCCGGACGCAATGAAGTGCGCACCTATGGCGTCGACGGTACGCCCGAGGTGCTGGAATTGCTGCGCCAGCCCGGCAGCCCGGTGGCTGCAGTGGTGGCGCAGCAGCCTGCGTTGATCGGCCGTACGGCGGTGCATAACGTCGCCCGCTACCTGGCCGGCGAGCACGATCTGCCGCCCGAAACCTTCGTCGAGACCCTGCTGACCACGGCGGGCAACGTCGATGACGTCAAACGCATCCGAGGCGACGCATGA > NC_002947/3142828‑3143123 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |