New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTGCCTTCGTTCAGTGCTGTCTGCATCGCCTTGGGGTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCC > NC_002947/3477467‑3477764 | ttGCCTTCGTTCAGTGCTGTCTGCATCGCCTTGGGGTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGc > 1:2100771/1‑150 (MQ=255) tGCCTTCGTTCAGTGCTGTCTGCATCGCCTTGGGGTTTTGCAAGGCGAGGGTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATCAGGCAGGACAGCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCACGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGcc > 1:2065896/1‑150 (MQ=255) cTTCGTTCAGTGCTGTCTGCATCGCCTTGGGGTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAgg > 2:1632647/1‑150 (MQ=255) 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cGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGtt < 1:956902/150‑1 (MQ=255) gCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGc < 2:1341248/105‑1 (MQ=255) aGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGc < 2:1211346/150‑1 (MQ=255) cctcgaagacaGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAgt < 2:728210‑M1/56‑1 (MQ=255) cctcgaagacaGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCGCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAgt > 1:728210‑M1/12‑67 (MQ=255) gTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCg > 2:913979/1‑96 (MQ=255) gTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCg < 1:913979/96‑1 (MQ=255) gTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTg < 1:1271145/140‑1 (MQ=255) gTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGcccc < 2:3011538/150‑1 (MQ=255) tGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGNCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCGAGAACGCAAACAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAGGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTCGGCCAGcccat > 1:3072328/1‑148 (MQ=255) ggTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTc < 1:1933617/150‑1 (MQ=255) tCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGGCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCGCAGAACGAAACCAGGAGCTGTTCGTTCAGCTCGAGGCCAGAGGTGATGCCTTCGAAGTGTACACGCTGGGCCACCCCCTTGc > 2:1364957/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCa < 2:851927/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGCCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCa < 1:2334809/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCaga > 2:2870404/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCaga < 1:2867268/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCagag < 1:2667581/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGc < 1:2956349/150‑1 (MQ=255) GCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGcc < 2:2301626‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGcc < 2:1762347‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGcc < 1:1743501‑M1/150‑1 (MQ=255) | TTGCCTTCGTTCAGTGCTGTCTGCATCGCCTTGGGGTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCC > NC_002947/3477467‑3477764 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |