New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTCTTTGCTTTGCTGCG > NC_002947/3477502‑3477797 | gTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTc > 2:1249042/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAg > 2:2963628/1‑150 (MQ=255) aaGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAgg > 1:120792/1‑150 (MQ=255) 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tctcTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACa < 1:877847/150‑1 (MQ=255) tctACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTTCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAgg > 2:1357574/1‑138 (MQ=255) tctACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAgt > 1:738843/1‑150 (MQ=255) aTGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGGCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTc > 1:1439615/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTcc < 1:1128981/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCa > 1:1839549/1‑54 (MQ=255) tCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAg > 2:60317/1‑142 (MQ=255) tCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTGCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAg < 1:60317/142‑1 (MQ=255) gccgcgcGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATc > 2:1930491/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAg < 2:2276602/150‑1 (MQ=255) cgcgcgCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTATTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAg < 2:757062/150‑1 (MQ=255) cTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTcttt < 2:159031/150‑1 (MQ=255) tCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCGAGGCCACCAGCATCCGGCctttg > 1:153684/1‑150 (MQ=255) tCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTctttg > 1:317906/1‑150 (MQ=255) gTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATc > 2:1657526/1‑139 (MQ=255) gTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTctttgct < 2:2772300/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGTTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAACAGTGGTGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTctttgctttg < 1:2507838/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAgg > 1:2093659/1‑70 (MQ=255) cAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAgg < 2:2093659/70‑1 (MQ=255) cCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGa < 2:758708‑M2/75‑1 (MQ=255) cGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTc < 2:1394885/82‑1 (MQ=255) cGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTc > 1:1394885/1‑82 (MQ=255) | GTTTTGCAAGGCGAGGTTCTCTACATGGCGTGATTCGTCATAGCGCAACACGCCAAAATTCTGCCCCTGGATAATGGGCAAGCCACCGGCAATGTCGGTGAGCGTGGTCTTCAGCCAGGACAGTCGCGCCGCGCGCTCGTCCAGGCCGTCTTCGAGGGTGGGGTACAGTGTTTCCCAGAACGCAACCAGGAGCTGTTCGGTCAGCTCGAGGCCAAAGGTGATGCCTTCGAAGTGTTCACGCTGGGCCAGCCCCTCGCAGAGCCAGGCCACCAGCATCAGGTCTTTGCTTTGCTGCG > NC_002947/3477502‑3477797 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |