New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAGGGTGAGCGACACCACCAGCGAGACGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGA > NC_002947/4067665‑4067963 | aaGGGTGAGCGACACCACCAGCGAGACGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAAcc < 2:887082/150‑1 (MQ=255) gctggtgggcacgttcgcagtcatgtacgtgtgcggtttctcgctcaacaacctgtcgctgatggcgctgatccttgccaccgggctggtggtggacgatgccatcgtggtgctggaaaacatctccaggcatatcgagaacggccagcc < 1:3018539‑M1/2‑1 (MQ=255) ggTGAGCGACACCACCAGCGAGACGACCACTTCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCAc > 1:82600/1‑150 (MQ=255) 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caccaGCGAGACGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGcc > 1:425578/1‑150 (MQ=255) ccaGCGAGACGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCa < 2:45086/150‑1 (MQ=255) gagaCGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAg < 2:2538522/150‑1 (MQ=255) agaCGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAgg > 1:1775066/1‑150 (MQ=255) gatgatCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGgccgc > 1:1525182/1‑150 (MQ=255) 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> 1:904192/1‑150 (MQ=255) tCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTg > 2:1849812/1‑102 (MQ=255) tCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTtct > 2:2966321/1‑142 (MQ=255) cTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCt > 2:1652516/1‑119 (MQ=255) cTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCt < 1:1652516/119‑1 (MQ=255) cTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCt < 2:1910211/150‑1 (MQ=255) tGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCg < 2:140327/141‑1 (MQ=255) 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tCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCa < 2:2152646/147‑1 (MQ=255) tCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCa > 1:2152646/1‑147 (MQ=255) cGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATg > 2:1745180/1‑103 (MQ=255) cGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATg < 1:1745180/103‑1 (MQ=255) atatcgagaacggccagCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGtgg > 1:2721891‑M1/18‑57 (MQ=255) atatcgagaacggccagCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGtgg < 2:2721891‑M1/40‑1 (MQ=255) aCAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACa > 2:1308912/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGAAGCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCAGACCGTGCTCGATAAGCCTGGAGATGTTTGCCAGCACCACGATGACATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGgt < 2:425578/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGgttgtt < 2:2979547/150‑1 (MQ=255) ggTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGgttgtt < 2:1504993/150‑1 (MQ=255) tGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAG‑CCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAg < 1:2429873/150‑1 (MQ=255) aaaCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGc < 2:904192/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCTCCTTGGCGCCTAGAAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCg < 2:711164/150‑1 (MQ=255) aCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGTATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCga < 2:1611043/150‑1 (MQ=255) aCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGa < 2:1567565/119‑1 (MQ=255) aCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGa > 1:1567565/1‑119 (MQ=255) aCCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCga < 2:1521514/150‑1 (MQ=255) CCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGGTGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCgaga < 2:2207779‑M1/150‑1 (MQ=255) | AAGGGTGAGCGACACCACCAGCGAGACGATGATCGCCGCCGCCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGAGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGA > NC_002947/4067665‑4067963 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |