| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
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aGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGtggctgg < 1:1822374/150‑1 (MQ=255) aGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCACATCACCGTGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCCCCTCCTTGCCGCCCAGGAAGCCCGCCTTCATCGGtcgctac > 2:1199009/1‑148 (MQ=255) ggTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACGGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGcc < 1:2634116/150‑1 (MQ=255) tGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTtct < 1:2991578/150‑1 (MQ=255) ggAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTtctc < 1:33926/150‑1 (MQ=255) 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ttGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAAc < 1:2845168/145‑1 (MQ=255) cgcCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGt < 1:592664/150‑1 (MQ=255) gcCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCacac < 1:2350557/147‑1 (MQ=255) gcCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCacac > 2:2350557/1‑147 (MQ=255) gcCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTa < 2:575349/150‑1 (MQ=255) cccAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATTCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTAc < 1:2791866/150‑1 (MQ=255) cccAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTAc > 1:248413/1‑150 (MQ=255) aGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATg > 2:2197395/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCgag > 1:714488/1‑131 (MQ=255) ggAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCgag < 2:714488/131‑1 (MQ=255) ggAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGa < 1:1829125/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGAc < 2:679995/150‑1 (MQ=255) cgccTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGaa > 2:1281207/1‑150 (MQ=255) cgccTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGGCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGaa < 1:278381/150‑1 (MQ=255) cgatctCATCGGTGGATGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCGCCACGATGGCATCGTCCACAACCTGCCCTGTGGCAAGGATCATCGCCATCAGCTACACGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGaa < 2:107636/145‑1 (MQ=255) ccTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACg > 1:1166263/1‑150 (MQ=255) cTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGGCAGAGG‑TTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGt < 1:161885/150‑1 (MQ=255) tCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGTCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACGACGATGGCATCGGCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGTGc < 2:1145321/150‑1 (MQ=255) tCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGTGc < 1:1199009/150‑1 (MQ=255) cATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGgttgtt < 2:348139/111‑1 (MQ=255) cATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGgttgtt > 1:348139/1‑111 (MQ=255) gtCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACAACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAAcagatcg > 1:107636/2‑144 (MQ=255) tCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGTGCcca > 1:953707/1‑150 (MQ=255) ggCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGTGCCCACCAGc < 1:3018539‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCAGGGTGATGGAAAACTCCTGGAACAGGTTGCGCACGATGCCGCCCATGAACAGGATGGAGACGAACACCGCCACCAGCGACACGTTCATCGACAGCAAGGTGAAACCCACCTCCTTGGCGCCCAGGAAGGCCGCCTTCATCGGTGGCTGGCCGTTCTCGATATGCCTGG‑AGATGTTTTCCAGCACCACGATGGCATCGTCCACCACCAGCCCGGTGGCAAGGATCAGCGCCATCAGCGACAGGTTGTTGAGCGAGAAACCGCACACGTACATGACTGCGAACGTGCCCACCAGC > NC_002947/4067706‑4068001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |