| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4254384 | 93 (0.810) | 6 (0.050) | 5/240 | NT | 6.0% | coding (1788/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | = 4254434 | 95 (0.840) | coding (1738/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CAATGACCAGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAG > NC_002947/4254237‑4254530 | cAATGACCAGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCTCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCAc > 1:2266476/1‑150 (MQ=255) aaTGACCAGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGAATCTGCGGCCTGAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCAcc > 2:2255942/1‑149 (MQ=255) aCCAGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACgccgg < 1:2746808/150‑1 (MQ=255) aGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACgccggccg > 2:1826045/1‑150 (MQ=255) gTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGt < 1:1998887/150‑1 (MQ=255) gTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGt > 1:514338/1‑150 (MQ=255) tCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTc > 2:1162287/1‑150 (MQ=255) tCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑Gcc > 1:465824/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATc > 1:347928/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTCCGCCCTGCATACCAGCGTCCGGATAGCCCTCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATcc < 1:837464/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCtcgccggggccgaaccgccacagtc > 1:2434013‑M1/1‑125 (MQ=255) gcgcTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGa < 2:86329/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGAc > 2:1276256/1‑150 (MQ=255) tGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGNAGGCTGNCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACtgt > 1:2306448/1‑150 (MQ=255) tGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACtgt < 2:528338/150‑1 (MQ=255) tGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACtgt > 1:1176233/1‑150 (MQ=255) gCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACgccg > 2:2156249/1‑123 (MQ=255) gCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACgccg < 1:2156249/123‑1 (MQ=255) gCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTgg < 1:3049230/150‑1 (MQ=255) cACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCATTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCg > 2:744803/1‑150 (MQ=255) cTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGt < 1:1011582/150‑1 (MQ=255) ttCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGtt > 1:821128/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCgg < 2:1507152/150‑1 (MQ=255) gggCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACgccggcc < 1:1416233/115‑1 (MQ=255) gcTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCCGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGc > 1:1539298/1‑150 (MQ=255) tACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGa < 2:3045328/150‑1 (MQ=255) tACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGa < 2:1083567/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGCTGCCCGACGCCCTGGCAAGAGTGTACGCCTTCGGTCATT‑TCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGc < 1:835572/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTa > 2:1764072/1‑150 (MQ=255) cAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCtcgccggggccgaaccgccacagtcggatcctggcgctgacggccggcgtgcaac < 2:2434013‑M1/150‑56 (MQ=255) aGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACg > 2:16099/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCa < 2:1176233/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGGCCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCG‑CTGCTTGAAAAAACCAACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGc > 1:2215116/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACTCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGc > 1:2447282/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCa < 1:1371878/103‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCa > 2:1371878/1‑103 (MQ=255) cTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCg < 1:20783/150‑1 (MQ=255) ttGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCa < 2:2317681/97‑1 (MQ=255) ttGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCa > 1:2317681/1‑97 (MQ=255) ttGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGCTCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCgg < 1:3009919/150‑1 (MQ=255) gcAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTTGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCAGcaca > 2:330939/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAAc < 2:347928/150‑1 (MQ=255) ggCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCGCAACg > 1:2448345/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGTCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATCCCAGGGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:19118/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:568452/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCa < 1:1162287/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:820104/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc < 2:820104/147‑1 (MQ=255) ccGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCtcgccggggccgaaccgccacagtcggatcctggcgctgacggccggcgtgc > 2:895150‑M1/1‑67 (MQ=255) ccGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCtcgccggggccgaaccgccacagtcggatcctggcgctgacggccggcgtgc < 1:895150‑M1/119‑53 (MQ=255) ccGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGAGTCCCGCTGCATCGTGTCCTGTTCCGGGTGCACGCCTCCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCt > 1:2363310/1‑150 (MQ=255) cGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCCCAACGCCACCCCGCTc < 1:2431237/150‑1 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cccGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGcgccgc < 1:1802459/150‑1 (MQ=255) cccGCGACCTGGCCCGGTGGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGcgccgc < 2:2363310/150‑1 (MQ=255) cgcgACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCgg > 2:780977/1‑111 (MQ=255) cgcgACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCgg < 1:780977/111‑1 (MQ=255) gcgACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTgc > 2:2977397/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTgcgcgc > 1:2297570/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGc > 1:300635/1‑70 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGc < 2:300635/70‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCa < 2:1500451/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCa > 1:592113/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCAt < 1:1368040/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCCGCTGTCGTCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGc > 2:884628/1‑150 (MQ=255) cccGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGcc < 1:1764072/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGTGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCt > 2:107515/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCTGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCt > 1:216269/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCt > 1:2311550/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCt > 1:386772/1‑150 (MQ=255) ggTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGc > 2:1517529/1‑150 (MQ=255) gTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGTgcaaccgggccaggtcgcgggttatctggacgctggtatgcagg > 1:2058105‑M2/1‑55 (MQ=255) gTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGTgcaaccgggccaggtcgcgggttatctggacgctggtatgcagg < 2:2058105‑M2/99‑45 (MQ=255) gTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAAc < 1:650550/77‑1 (MQ=255) gTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCa > 1:544769/1‑150 (MQ=255) ttGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAg < 2:2311550/150‑1 (MQ=255) ttGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAg > 1:2887989/1‑150 (MQ=255) ttGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAg < 1:1514779/150‑1 (MQ=255) | CAATGACCAGTCCATGTCTGCGCCAGCGCTGGCCACTTCACCGGGCGCTACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAG > NC_002947/4254237‑4254530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |