New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4254384 | 93 (0.810) | 6 (0.050) | 5/240 | NT | 6.0% | coding (1788/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 4254434 | 95 (0.840) | coding (1738/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTCGCGCATCAGC > NC_002947/4254285‑4254582 | tACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGa < 2:1083567/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGCTGCCCGACGCCCTGGCAAGAGTGTACGCCTTCGGTCATT‑TCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGc < 1:835572/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTa > 2:1764072/1‑150 (MQ=255) aGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACg > 2:16099/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCa < 2:1176233/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGGCCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCG‑CTGCTTGAAAAAACCAACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGc > 1:2215116/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACTCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGc > 1:2447282/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCg < 1:20783/150‑1 (MQ=255) gcAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTTGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCAGcaca > 2:330939/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAAc < 2:347928/150‑1 (MQ=255) ggCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCGCAACg > 1:2448345/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGTCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATCCCAGGGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:19118/1‑150 (MQ=255) gCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:568452/1‑150 (MQ=255) tGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCa < 1:1162287/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc > 1:820104/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGc < 2:820104/147‑1 (MQ=255) ccGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGAGTCCCGCTGCATCGTGTCCTGTTCCGGGTGCACGCCTCCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCt > 1:2363310/1‑150 (MQ=255) cGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCCCAACGCCACCCCGCTc < 1:2431237/150‑1 (MQ=255) 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tACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCAc < 2:821128/150‑1 (MQ=255) tACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCAc < 1:744803/150‑1 (MQ=255) tACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTCGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCAc > 2:105282/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTc > 2:1514779/1‑150 (MQ=255) ccTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCACCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCca > 1:335736/1‑150 (MQ=255) 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aGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCAAGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAATGCACGTCTTGCAGAACCAGGTCGAAg < 1:2255942/150‑1 (MQ=255) gATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAgc < 2:568452/150‑1 (MQ=255) aTAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCaa > 2:607481/1‑120 (MQ=255) aTAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCaa < 1:607481/120‑1 (MQ=255) cccGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGcgccgc < 1:1802459/150‑1 (MQ=255) cgcgACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCgg > 2:780977/1‑111 (MQ=255) gcgACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTgc > 2:2977397/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGc > 1:300635/1‑70 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGc < 2:300635/70‑1 (MQ=255) cTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCa < 2:1500451/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCAt < 1:1368040/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCCGCTGTCGTCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGc > 2:884628/1‑150 (MQ=255) 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ccggccgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtgg < 2:1959469/150‑1 (MQ=255) cggccgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggc < 2:1454045/150‑1 (MQ=255) gccgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtgggaa < 1:107515/150‑4 (MQ=255) cgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggctggc < 2:216269/150‑1 (MQ=255) cgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggctggc < 2:2215116/150‑1 (MQ=255) cgTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggctggc < 1:1517529/150‑1 (MQ=255) tCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGAGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGt > 2:2077676/1‑150 (MQ=255) gc‑gcCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTTGCGTCtt < 2:1300845/150‑1 (MQ=255) gctccAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCtt < 2:2306448/147‑1 (MQ=255) ccAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCgg > 1:1417772/1‑150 (MQ=255) gATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAgc < 2:1810834/104‑1 (MQ=255) gATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAgc > 1:1810834/1‑104 (MQ=255) cagccGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCGCGCCAAGTGCACGTCCAGCAGATCCAGGCCGAAGCGCCGCTGCGCGCAGGCCTCCAGGCCGTGGCTGGCGTCTTCGGaaaa < 2:1539298/147‑1 (MQ=255) aTCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAg < 1:1826045/150‑1 (MQ=255) gACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAgcaaccgggccaggtcgcgggttatctggacgctggtatgcagggcgtactggccaagccgttgcggctggacagcctgcgcaaggcgttggctgacgtagcgcccggtgaagtggccagcgctg > 1:2434013‑M2/1‑25 (MQ=255) gACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTa > 1:1539065/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTAcc > 1:710440/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggctggc < 1:638964/130‑1 (MQ=255) tgtgGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTtggctggc > 2:638964/1‑130 (MQ=255) ggCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGt < 1:2977397/150‑1 (MQ=255) gCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTAccc > 1:1247141/1‑146 (MQ=255) gCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTAccc < 2:1247141/146‑1 (MQ=255) ggTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCATGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGAc < 2:582088/150‑1 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCCTGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACTGCTGCAAAGCGCCGCTGAGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGTTCACCGTtgc > 1:689744/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTcgc > 1:1545673/1‑150 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGATGCATCGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTcgc > 1:1619646/1‑150 (MQ=255) ccccGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCCCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTcgcg > 1:1300016/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAg < 2:130185/78‑1 (MQ=255) ggCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAg > 1:130185/1‑78 (MQ=255) ggCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTCGCGCATc < 2:747810/150‑1 (MQ=255) gCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTCGCGCATca > 1:2857853/1‑150 (MQ=255) gAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTCGCGCATcaac > 2:23822/1‑148 (MQ=255) | TACGTCAGCCAACGCCTTGCGCAGGCTGTCCAGCCGCAACGGCTTGGCCAGTACGCCCTGCATACCAGCGTCCAGATAACCCGCGACCTGGCCCGGTTGCACGCCGGCCGTCAGC‑GCCAGGATCCGACTGTGGCGGTTCGGCCCCGGCGAGCTACGCAGCTGTCGGCACAACGCCACCCCGCTCATGCCCGGCAAGTGCACGTCCAGCAGAACCAGGTCGAAGCGCCGCTGCGCGCATGCCTGCAGGGCTTGGCTGGCGTCTTCGGCAAAGCTTACCCGGTGACCGTCGCGCATCAGC > NC_002947/4254285‑4254582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |