| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4717255 | 114 (1.000) | coding (301/516 nt) | fabA | 3R‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP dehydratase | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GGCGGCAAGTACGGCAAAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCAT > NC_002947/4717090‑4717379 | ggcggcAAGTACGGCAAAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGc > 1:2275608/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTg > 1:287961/1‑150 (MQ=255) cAAAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGcc > 1:2513282/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCg < 1:1103245/150‑1 (MQ=255) aaGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCgg < 1:2127638/150‑1 (MQ=255) ggTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATAGCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGc < 2:554588/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGATCTTCGCCTATCACCTAGCGTTCCATGTGGTAAGGCCGGCCGTCCTGGGCCTCGACGCCAAGTAGTAGCTGTGTGGCTTCTTCCTCGGGTGGCAGGGCCGGCGGGGCCGTGGCCGCGcc > 1:1596170/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTg < 1:693094/140‑1 (MQ=255) aGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTgg < 1:1122386/150‑1 (MQ=255) gCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCGTTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTggg < 1:2498621/150‑1 (MQ=255) tGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCccggcaggccctgccagccgaggaa < 2:765274‑M1/133‑26 (MQ=255) tGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCccggcaggccctgccagccgaggaa > 1:765274‑M1/1‑108 (MQ=255) ggATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTc > 2:2902560/1‑150 (MQ=255) gATATCAACCCGGACCTCTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTc > 1:2633329/1‑108 (MQ=255) atatCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCgg < 2:2513282/150‑1 (MQ=255) tatCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCggg > 2:2618902/1‑150 (MQ=255) aCCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTACCTGGGCCTCGACACCATGTCGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGGCGGGCCGGGGGTGCGTGCGAgg > 1:1107568/1‑150 (MQ=255) ccGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGTCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTg < 2:631820/150‑1 (MQ=255) ccGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTTGTCACGGTCCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTg > 2:1618584/1‑150 (MQ=255) 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gCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCAAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATgg < 1:2060060/150‑1 (MQ=255) ttcttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCt < 2:1328441/84‑1 (MQ=255) ttcttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCt > 1:1328441/1‑84 (MQ=255) cttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAg < 2:2169289/86‑1 (MQ=255) cttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCAt < 2:399907/150‑1 (MQ=255) ttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGggaagaagccaaccagctgccacatggcgtcgaggcccaggcagcccggcattaccggatcgccttcgaaatggcaggcgaagaaccacaggtccgggttgatatcca > 1:765274‑M2/1‑25 (MQ=255) ttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGggaagaagccaaccagctgccacatggcgtcgaggcccaggcagcccggcattaccggatcgccttcgaaatggcaggcgaagaaccacaggtccgggttgatatcca < 2:765274‑M2/133‑109 (MQ=255) ttcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGggaagaagccaaccagctgccacatggcgtcgaggcc > 2:2259888‑M2/1‑25 (MQ=255) tcCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGggaagaagccaaccagctgccacatggcgtcgaggcccaggcagcccggc > 1:203555‑M2/1‑24 (MQ=255) | GGCGGCAAGTACGGCAAAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCAT > NC_002947/4717090‑4717379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |