| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4717255 | 114 (1.000) | coding (301/516 nt) | fabA | 3R‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP dehydratase | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGTCAGCGTCGAC > NC_002947/4717106‑4717404 | aaGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCgg < 1:2127638/150‑1 (MQ=255) ggTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATAGCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGc < 2:554588/150‑1 (MQ=255) tCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATGCGGTAATGGCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGACTGGCGTGCCGTGGCcgcg > 2:143232/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTg > 2:693094/1‑140 (MQ=255) cGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTg < 1:693094/140‑1 (MQ=255) aGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTgg < 1:1122386/150‑1 (MQ=255) gCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCGTTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTggg < 1:2498621/150‑1 (MQ=255) tGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGtt > 1:254509/1‑150 (MQ=255) ggATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTc > 2:2902560/1‑150 (MQ=255) atatCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCgg < 2:2513282/150‑1 (MQ=255) tatCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCggg > 2:2618902/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAg < 2:2994634/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAg < 1:149109/150‑1 (MQ=255) 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2:442980/108‑1 (MQ=255) cccggCAGGCCCTGCCAGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCa < 1:1534859/105‑1 (MQ=255) aggccctgCCAGCCGGGCCGTGGCCGCGGCCTGGGTTCGGGCAAGGTGAAATTCTTTGGCCAGTTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCggtggt > 1:1677060/8‑150 (MQ=255) gCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTc > 2:447503/1‑150 (MQ=255) aGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCAAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCgg > 2:1391848/1‑150 (MQ=255) gggCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGt > 1:1407832/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGTGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGTCAGCGt < 1:1067286/150‑1 (MQ=255) gCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCCGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGCAGGGCAAGCTGAACATGGCAATCGCCGATGGTTCGGTAAGCGt > 1:173622/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGTCAGCGTCGAc < 2:254509/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCAAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGTCAGCGTCGAc > 2:1786863/1‑150 (MQ=255) | AAGGTGAATTGGTCGCCGAGCTGGATATCAACCCGGACCTGTGGTTCTTCGCCTGCCATTTCGAAGGCGATCCGGTAATGCCGGGCTGCCTGGGCCTCGACGCCATGTGGCAGCTGGTTGGCTTCTTCCTCGGCTGGCAGGGCCTGCCGGGCCGTGGCCGCGCCCTGGGTTCGGGCGAGGTGAAATTCTTTGGCCAGGTACTGCCTGAAGCCAAGAAAGTCACGTACAACATTCACATCAAGCGCGTCCTGAAGGGCAAGCTGAACATGGCCATCGCCGATGGTTCGGTCAGCGTCGAC > NC_002947/4717106‑4717404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |