| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4742647 = | 89 (0.780) | 5 (0.050) | 5/230 | NT | 5.9% | coding (1390/1593 nt) | PP_4197 | GntR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 4742701 = | 76 (0.700) | coding (1336/1593 nt) | PP_4197 | GntR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TAATCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGG > NC_002947/4742500‑4742792 | cctgtagcgtgacgcagatgggcgtggcagcctacctggaaaatggcggctacgaccggcatctgcgctacatacgccaggaatatcgcaagaacctcagtgcctaccagctggcagtgcagcagcacttccccgagggtacccagaTGa < 1:1079314‑M1/3‑1 (MQ=255) aaTCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGAc < 2:1255845/150‑1 (MQ=255) tgtagcgtgacgcagatgggcgtggcagcctacctggaaaatggcggctacgaccggcatctgcgctacatacgccaggaatatcgcaagaacctcagtgcctaccagctggcagtgcagcagcacttccccgagggtacccagaTGAcc < 2:2642182‑M1/5‑1 (MQ=255) aTCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGAcc < 2:434645/150‑1 (MQ=255) tCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGGTGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGAccc < 2:431156/150‑1 (MQ=255) tCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGAccc > 2:1638267/1‑150 (MQ=255) acaGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGa > 1:1267371/1‑150 (MQ=255) acaGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGa > 2:1043254/1‑150 (MQ=255) caGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGAc > 2:2775420/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAg < 1:1043254/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAgg < 2:1267371/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAgg < 2:2332371/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTc > 1:789887/1‑150 (MQ=255) ctctTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCAc < 2:2765952/150‑1 (MQ=255) ctTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCAccc > 1:2642182/1‑150 (MQ=255) tttATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTAtt < 1:267363/126‑1 (MQ=255) tttATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTAtt > 2:267363/1‑126 (MQ=255) aTTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCagat < 2:1724812/150‑2 (MQ=255) ttCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAgg > 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aTTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGGATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCCCCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCgg > 1:2933010/1‑150 (MQ=255) ggcggctacgaccggcatctgcgctacatacgccaggaatatcgcaagaacctcagtgcctaccagctggcagtgcagcagcacttccccgatggtacccagaTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGc > 1:35145‑M1/104‑150 (MQ=255) aGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCgg < 1:812175/150‑1 (MQ=255) aGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCgg < 2:2182030/150‑1 (MQ=255) ggACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAg < 2:1486290/112‑1 (MQ=255) ggACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAg > 1:1486290/1‑112 (MQ=255) 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aCTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCgg < 2:1068640/150‑1 (MQ=255) ctctGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGaa < 1:2907718/150‑1 (MQ=255) tgtgTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtg < 1:2806484/150‑1 (MQ=255) ttACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgc < 2:504028/150‑1 (MQ=255) cTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCCGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgctgc > 2:2328198/1‑150 (MQ=255) 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gcACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCAc > 2:2341636/1‑106 (MQ=255) gcACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCAc < 1:2341636/106‑1 (MQ=255) gcACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTa > 1:2595829/1‑150 (MQ=255) cacaTGGAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGATCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATATGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTAt < 2:2943280/150‑1 (MQ=255) cacaTGCAGCTCCTTGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCGCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTAt < 1:492281/150‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTc < 1:599875/126‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTc > 2:599875/1‑126 (MQ=255) tGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAg < 1:1150142/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGTGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACt < 1:687450/101‑1 (MQ=255) gCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACt > 2:687450/1‑101 (MQ=255) cgcgcTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCa < 1:2626925/146‑1 (MQ=255) tGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAgg < 2:2770919/114‑1 (MQ=255) tGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAgg > 1:2770919/1‑114 (MQ=255) gTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCgg < 1:1152103/150‑1 (MQ=255) | TAATCACAGCCCGCTCGGCCTCTTTATTCCAAGGTATGCCGCAATTGAGTCGGACACAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGG > NC_002947/4742500‑4742792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |