New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4742647 = | 89 (0.780) | 5 (0.050) | 5/230 | NT | 5.9% | coding (1390/1593 nt) | PP_4197 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4742701 = | 76 (0.700) | coding (1336/1593 nt) | PP_4197 | GntR family transcriptional regulator |
CAGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGTGCTGCTGCACTGCCAGCTGGTAGGCACTGAGGTTCTTGCGATATTCCTGGCGTATGTAGCGCAGATGCCGGTCGTAGCCGCCATTTTCCAGGTAGGCTGCCACGCCCATCTGCGTCACGCTACAGG > NC_002947/4742556‑4742847 | caGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTgg < 2:2084250/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTggg < 1:1709112/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCCGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGt < 2:2392841/150‑1 (MQ=255) gTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTAcc > 1:2126009/1‑150 (MQ=255) gTTGAACTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTAcc < 1:2775420/150‑1 (MQ=255) aCTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCgg < 2:1068640/150‑1 (MQ=255) aCTGCTCTGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCgg > 2:1560853/1‑150 (MQ=255) ctctGTGTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGaa < 1:2907718/150‑1 (MQ=255) tgtgTTACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtg < 1:2806484/150‑1 (MQ=255) ttACTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgc < 2:504028/150‑1 (MQ=255) cTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCCGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgctgc > 2:2328198/1‑150 (MQ=255) cTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCCAGCGCGCGCACATGCAGCTCCTGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgctgc > 1:1935266/1‑150 (MQ=255) cTGAATATCAGTCCTGGTGCAATGCTGATGCCCTGCTCAAGTGCGCGCACATGAAGGTCCGGGGTATTGACCCGACCGGGCAGGCTCACCCAGAGGATGAAGCCGCCTGTCGGCCGGGTCATCTGGGTACCCTCGGGGAAGtgctgctgc > 2:2410639/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |