New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TACCTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCG > NC_002947/5339487‑5339783 | tACCTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCG < 2:12241‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCG < 1:384645‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCgg > 2:57966/1‑150 (MQ=255) cTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGcc > 1:2263550/1‑150 (MQ=255) gATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGc < 2:2747236/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGcc > 1:1581008/1‑150 (MQ=255) gcgGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATAGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGGTCCCGGCCAGTGCCAAcg > 1:444469/1‑150 (MQ=255) cgGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCAcgc > 1:65664/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCt < 2:393922/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGtccagcgcgtgggcactg > 1:2847278‑M1/1‑132 (MQ=255) cTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTg > 2:1671082/1‑150 (MQ=255) gCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGTCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGAc < 1:2013001‑M2/150‑2 (MQ=255) cccGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGa > 1:949029/1‑150 (MQ=255) cccGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGa > 2:191791/1‑150 (MQ=255) cGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCGTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGc < 2:339984/150‑1 (MQ=255) cGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGc < 2:1581008/150‑1 (MQ=255) tgcGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGtccagcgcgtgggcactggccgggaacagtg < 2:2847278‑M1/150‑32 (MQ=255) tgcGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGa > 2:922310/1‑150 (MQ=255) 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tCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAgg < 2:2894037/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATACTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCt < 2:1286225/103‑1 (MQ=255) aTGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaa > 2:1100516/1‑150 (MQ=255) aTGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaa > 2:115416/1‑150 (MQ=255) aTGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaa > 1:2682451/1‑150 (MQ=255) ccTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCNAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaacaa > 1:2446411/1‑150 (MQ=255) ccTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGtccagcgcgtgggcactggccgggaacagtg > 1:1174031‑M1/1‑82 (MQ=255) ccTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTacac > 1:391566/1‑120 (MQ=255) tCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAacaaca > 1:1773908/1‑150 (MQ=255) tCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAacaaca < 1:115416/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAacac < 1:86409/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAacac < 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tGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTtgctg > 1:492087/1‑150 (MQ=255) gttgttCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTgc > 2:2042137/1‑101 (MQ=255) gttgttCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTgc < 1:2042137/101‑1 (MQ=255) gttgttCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGctgctct < 2:2049390/150‑1 (MQ=255) gttCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGctgctctgct < 1:609796/150‑1 (MQ=255) ttCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGctgctctg > 2:2656219/1‑147 (MQ=255) cGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGTCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTTCACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGctctgctctg < 2:2467308/150‑1 (MQ=255) cGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGctctgctctg < 1:1671082/150‑1 (MQ=255) aaCCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGc > 2:1856961/1‑107 (MQ=255) aaCCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCt < 1:2505009/130‑1 (MQ=255) cACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGAcgggaacagtggttcgaacaactccaggtcaaccagcatttcgaaggcgatggcaccttggccgctgaggaacagcttgagg > 1:1174031‑M2/1‑31 (MQ=255) cACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGAcgggaacagtggttcgaacaactccaggtcaaccagcatttcgaaggcgatggcaccttggccgctgaggaacagcttgagg < 2:1174031‑M2/113‑83 (MQ=255) cACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAg > 1:2012353/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCCCGGCCAGTGCCAACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGc < 2:2156858/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGAcgggaacagtggttcgaacaactccaggtcaaccagcatttcgaaggcgatggcaccttggccgctgagg < 2:1340388‑M2/98‑71 (MQ=255) ccGGCCAGTGCCCACGCGCTGGAcgggaacagtggttcgaacaactccaggtcaaccagcatttcgaaggcgatggcaccttggccgctgaggaacagcttgaggcattcctcgaa > 1:1581362‑M2/1‑23 (MQ=255) ccGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaac > 1:1855976/1‑69 (MQ=255) ccGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCgg > 2:1245331/1‑103 (MQ=255) ccGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCg > 2:2308932/1‑150 (MQ=255) | TACCTGCCGATTCGCGGCCTGGCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTGCCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCG > NC_002947/5339487‑5339783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |