New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
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cgcgAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGAcc > 1:1923110/1‑150 (MQ=255) gagaTTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAGTGGTGGTTGACCTGGAGTTGTTTGAAAAAAAAATCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTac > 1:1453705/1‑150 (MQ=255) gagaTTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCt > 1:2932964/1‑148 (MQ=255) gagaTTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCt < 2:2932964/148‑1 (MQ=255) gagaTTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTac < 1:345072/150‑1 (MQ=255) agaTTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTaca < 1:1276850/150‑1 (MQ=255) tCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCca < 1:224199/150‑1 (MQ=255) cACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAACTTCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCcaca < 1:191791/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGTCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCTGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCacac < 1:2935448/150‑1 (MQ=255) aCCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTacac > 1:1006372/1‑144 (MQ=255) 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ccGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaac > 1:1855976/1‑69 (MQ=255) ccGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGaac < 2:1855976/69‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCgg < 1:1245331/103‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCg > 1:72156/1‑150 (MQ=255) ccAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGccc < 1:1153906/150‑1 (MQ=255) cAGTG‑CCCACGCGCTGGAcgggaacagtggttcgaacaactccaggtcaaccagcatttcgaaggcgatggcaccttggccgctgaggaacagcttgaggcattcctcgaacaggcgcgcgggtggaatctcgcgcagcatcggggccag > 1:2847278‑M2/1‑18 (MQ=255) cAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACGCGCGCGGGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCg > 2:105839/1‑150 (MQ=255) cAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGt < 2:2250836/99‑1 (MQ=255) gTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCgtg < 1:136286/150‑1 (MQ=255) tG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCAGGTGACGCCAGCCTTCTTGGTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCgtgt > 2:672393/1‑150 (MQ=255) ccccCGCGCTGGAAGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACCCCGACCTGCCCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCGTGtgc < 1:1862185/150‑1 (MQ=255) ccACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCGTGtgct > 2:228518/1‑150 (MQ=255) tGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGttt > 1:2368225/1‑104 (MQ=255) tGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGttt < 2:2368225/104‑1 (MQ=255) tGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCGTGTGCTGCACCTGc < 1:2308932/150‑1 (MQ=255) | GCCCCGATGCTGCGCGAGATTCCACCCGCGCGCCTGTTCGAGGAATGCCTCAAGCTGTTCCTCAGCGGCCAAGGTGCCATCGCCTTCGAAATGCTGGTTGACCTGGAGTTGTTCGAACCACTGTTCCCGGCCAGTG‑CCCACGCGCTGGACGAGCGGCCGACCTACACCCACACGCTGATCAGCCAGGCACTGAACAACACCGACCTGCGCGTGAAGCAGGGCAAGCCGGTGACGCCAGCCTTCCTGTTTGCTGCTCTGCTCTGGCCAGCCCTGCCGGCCCGTGTGCTGCACCTGC > NC_002947/5339508‑5339802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |