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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
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ATCCACAAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGc > 1:1458130‑M1/1‑150 (MQ=255) ATCCACAAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGc < 1:2224992‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACAAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTtgcat < 1:2699431/150‑1 (MQ=255) acaAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGTCCAGTCCGAACTCGATTGCCAGGGGTttcatgc > 1:1444134/1‑150 (MQ=255) acaAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTtgcatgc > 1:1237646/1‑150 (MQ=255) aaG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCg < 1:544573/123‑1 (MQ=255) aG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTc < 1:2734732/133‑1 (MQ=255) aG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTc > 2:2734732/1‑133 (MQ=255) g‑gCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCgt > 2:1447271/1‑116 (MQ=255) g‑gCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCgt < 1:1447271/116‑1 (MQ=255) g‑gCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTg > 1:2109074/1‑137 (MQ=255) ccgccggggATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCgt > 1:638129‑M2/10‑109 (MQ=255) ccgccggggATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGCATGCAGGCCATCCTc > 2:1143205‑M2/10‑150 (MQ=255) ccgccggggATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCCAACAACACCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGTGCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGCATGCAGGCCATCCTc > 1:837373‑M2/10‑150 (MQ=255) cgccggggATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGCATGCAGGCCATCCTCg < 1:1143205‑M2/142‑1 (MQ=255) ggATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCCGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGCATGCAGGCCATCCTCGTTATTg > 2:2987281‑M2/3‑150 (MQ=255) | GATCAGTTCGCGCAGCAGGCCGGACACGACGATGACCTGGCAGCGTTCGATGTGGGCATCGAGCAGCAAGGTGCGCATGCAGACCACGCCTTTCATGCGGATGGCATGGCTGACCCCGGCGGGCATCCACAAG‑GCATGCCCGCCGGGGATCACCCAGCTGCCGCCCTCGCTGCTGACCCGCATCACGCCGCTGGCGGCGTAAATCAGCTGGTCTTCGGCGTGGCAGTGGCTGGCCACTTCATCGCCGTGTCCGTAGTCCCTTTCCAGTGCTTGCATGCAGGCCATCCTCGTTATTG > NC_002947/2356589‑2356884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |