New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2567688 = | 88 (0.770) | 6 (0.050) | 6/234 | NT | 6.7% | coding (283/879 nt) | PP_2250 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2567703 = | 82 (0.750) | coding (268/879 nt) | PP_2250 | LysR family transcriptional regulator |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TCCAGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCTTCAAGGT > NC_002947/2567555‑2567852 | tCCAGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCt < 1:1748862/150‑1 (MQ=255) ccAGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCtt > 2:701610/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTg < 1:469391/150‑1 (MQ=255) aGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg > 1:2480478/1‑150 (MQ=255) aGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg < 2:1037080/150‑1 (MQ=255) aGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGAAGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg < 2:2229743/150‑1 (MQ=255) acagcctgttcgaacgtggcccgcgtgaagttcgcccaaccgcacaggccttggccctggagccacacgccaggctgattgccgaacaactggggctgctgcaggttcatgctctggagctgtcccaagGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg < 1:2949533‑M1/20‑1 (MQ=255) acagcctgttcgaacgtggcccgcgtgaagttcgcccaaccgcacaggccttggccctggagccacacgccaggctgattgccgaacaactggggctgctgcaggttcatgctctggagctgtcccaagGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg > 2:2949533‑M1/130‑149 (MQ=255) gCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑t > 1:637575/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAAAATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑t < 2:801438/150‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCag > 1:659424/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCag > 2:2944923/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGCGGGGCGCGGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTGGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCGCGTGGGACGGC‑TCCag > 1:182732/1‑150 (MQ=255) cttcttCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCagag < 2:370282/150‑1 (MQ=255) ttcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg < 2:2953288/136‑1 (MQ=255) ttcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTgg > 1:2953288/1‑136 (MQ=255) ttcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGc < 2:1166674/150‑1 (MQ=255) tcttctTGCTGGGTTCGGAGCATCGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCa < 2:659424/150‑1 (MQ=255) tcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGTGACAGC‑TCCAGAGCa < 2:359057/150‑1 (MQ=255) tcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCa < 1:1544257/150‑1 (MQ=255) tcttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCa < 2:1264234/150‑1 (MQ=255) cttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCAt > 1:409761/1‑150 (MQ=255) cttcCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCAt < 2:581814/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTgca < 1:2331547/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTgc > 1:1014466/1‑148 (MQ=255) ggCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTgc < 2:1014466/148‑1 (MQ=255) gCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCa > 1:36137/1‑150 (MQ=255) ggCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAATCTGCAGCAGCCTCAgttg > 2:804164/1‑150 (MQ=255) gCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAgttgt < 1:2539432/150‑1 (MQ=255) aaTATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTc > 2:1678526/1‑150 (MQ=255) atatCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCg < 2:1978074/150‑1 (MQ=255) ccAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCaa < 1:2937320/150‑1 (MQ=255) aGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCa < 2:1489187/117‑1 (MQ=255) aGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCa > 1:1489187/1‑117 (MQ=255) aGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATc < 2:1936230/150‑1 (MQ=255) gCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCa > 2:1405533/1‑150 (MQ=255) aaTGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGcccc < 2:374332/132‑1 (MQ=255) aaTGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGcccc > 1:374332/1‑132 (MQ=255) aaTGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGc > 2:2159813/1‑150 (MQ=255) aTGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGcc > 2:1172123/1‑150 (MQ=255) cTTACATAGGTTAGCTATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGTCAAGCACGGGAGCAGTGTGGTCGCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCCGAGAATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTgg < 1:701610/150‑1 (MQ=255) aCCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCgg > 2:2628856/1‑128 (MQ=255) aCCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCgg < 1:2628856/128‑1 (MQ=255) aCCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTc > 2:2829961/1‑150 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTgca > 2:782434/1‑108 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTgca < 1:782434/108‑1 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCt < 2:1296122/136‑1 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCt < 2:1296938/136‑1 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCt > 1:1296122/1‑136 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCt > 1:1296938/1‑136 (MQ=255) cTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTACTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGGAGTGCGGCAAGCAGCCTGGCGTGTGGCTCCa > 2:1695015/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCGGTTGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGGCGGGTGCCGCTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGTCGGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGGTCGGCAATCAGCCTGGGGTGGGGCTCCAgg < 2:779970/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAgg < 2:637575/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAggg < 1:1377797/150‑1 (MQ=255) ggctgattgccgaacaactggggctgctgcaggttcatgctctggagctgtcccaagGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGa < 2:2425476‑M1/22‑1 (MQ=255) ggctgattgccgaacaactggggctgctgcaggttcatgctctggagctgtcccaagGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGa > 1:2425476‑M1/58‑79 (MQ=255) cGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAgg > 1:2380210/1‑150 (MQ=255) gATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGTATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGc < 2:2340834/150‑1 (MQ=255) gATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCgtgt < 1:2416419/133‑1 (MQ=255) tGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCt < 1:2829961/150‑1 (MQ=255) gaacaactggggctgctgcaggttcatgctctggagctgtcccaagGGCTGCTCTCCAGCCCTTg < 1:1610835‑M1/19‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCgg < 1:270166/150‑1 (MQ=255) cagcagCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGt < 1:2159813/150‑1 (MQ=255) agcagcGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACACCTTACGGCGCA‑GAAGCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGtt < 2:1642226/150‑1 (MQ=255) cagcGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTgg < 2:409761/150‑1 (MQ=255) gcggTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGCCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAAc < 1:1678526/150‑1 (MQ=255) aTCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCAcg > 1:663591/1‑150 (MQ=255) tCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGt > 1:2604552/1‑128 (MQ=255) tCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGt < 2:2604552/128‑1 (MQ=255) tGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTc < 2:2380210/150‑1 (MQ=255) cACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGaa > 2:2773034/1‑150 (MQ=255) aCTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAAc > 1:1904459/1‑150 (MQ=255) aCTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAAc > 1:2585282/1‑150 (MQ=255) tGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAg < 2:1904459/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAgg < 1:1468017/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCAGGCTGCTATCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGc > 1:2808156/1‑119 (MQ=255) cAGGGTCAGGCTGCTATCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGc < 2:2808156/119‑1 (MQ=255) tcccaagggctggagagcagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGcc < 2:2425476‑M2/57‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAgt < 2:1408123/61‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAgt > 1:1408123/1‑61 (MQ=255) ggTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGt > 1:2071338/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGCTGCTCTCCAGCCCCTGGATGACT‑GCCAGAGCATGAAGCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTa < 1:1541003/150‑1 (MQ=255) ccaagggctggagagcagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGt < 1:2949533‑M2/129‑1 (MQ=255) caagggctggagagcagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTc > 2:1610835‑M2/20‑65 (MQ=255) caagggctggagagcagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTc < 1:1610835‑M2/46‑1 (MQ=255) GCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGtgtg < 1:1374784‑M1/80‑1 (MQ=255) GCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGtgtg > 2:1374784‑M1/1‑80 (MQ=255) GCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAg < 1:906235‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGGAGCAGCCCCAGTTGTTc > 2:590070‑M1/1‑58 (MQ=255) TGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGGAGCAGCCCCAGTTGTTc < 1:590070‑M1/58‑1 (MQ=255) TGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGtt < 2:2242459‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGtt > 1:869030‑M1/1‑150 (MQ=255) tcCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCGGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCt > 1:2951973/1‑150 (MQ=255) cagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTgg > 1:1899715‑M2/6‑72 (MQ=255) cagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTgg < 2:1899715‑M2/67‑1 (MQ=255) cagccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCTTc > 1:2958571‑M2/6‑150 (MQ=255) ccCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCTTCAAg > 1:2799740‑M2/3‑150 (MQ=255) cTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGc < 1:1680763/82‑1 (MQ=255) cTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGc > 2:1680763/1‑82 (MQ=255) cTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCTTCAAGGt > 2:1903065/1‑150 (MQ=255) | TCCAGCAAGTGCAGGGCTTCTTCCTGCGGGGCGCTGAGCAGGGCAATATCCAGCAATGGGTGGCGCTTACCTAGGTTGGCGATGGCCGCCAGCAGCGGGCGGTGATCGATGTCGGGTGCCACTGCCAGGGTCAGGCTGCTCTCCAGCCCTTGGGACAGC‑TCCAGAGCATGAACCTGCAGCAGCCCCAGTTGTTCGGCAATCAGCCTGGCGTGTGGCTCCAGGGCCAAGGCCTGTGCGGTTGGGCGAACTTCACGCGGGCCACGTTCGAACAGGCTGTAGCCAAGTTCTGCTTCAAGGT > NC_002947/2567555‑2567852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |