| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4047836 | 77 (1.290) | 8 (0.140) | 8/224 | NT | 9.9% | coding (343/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 4047845 | 73 (1.310) | coding (352/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACC > NC_002947/4047687‑4047985 | cgggcgCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGC < 2:479984‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTg < 2:1402865/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCaa > 2:742736/1‑150 (MQ=255) 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2:69953‑M2/1‑18 (MQ=255) tgctgGCGCGTGCCAACGgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccatgccgattgcgccgaacatgaacaggcgcgagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacgg < 1:69953‑M2/150‑133 (MQ=255) gctgGCGCcgttggcacgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccatgccgattgcgccgaacatgaacaggcgcgagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacggc < 1:1014797‑M1/150‑143 (MQ=255) gctgGCGCcgttggcacgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccatgccgattgcgccgaacatgaacaggcgcgagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacggc > 2:1444287‑M1/1‑8 (MQ=255) gctgGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGt < 2:198689/150‑1 (MQ=255) ctgGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTc < 2:789686/150‑1 (MQ=255) ctgGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTc < 1:320049/150‑1 (MQ=255) tgGCGCcgttggcacgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccatgccgattgcgccgaacatgaacaggcgcgagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacggcat < 1:1260551‑M1/150‑145 (MQ=255) gccgttggcacgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccatgccgattgcgccgaacatgaacaggcgcgagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacggcatacag > 2:1077712‑M1/1‑2 (MQ=255) ccgttggcacgcgccagcagcgggtagaccagcgccacgaccacccagcttccgtcgtacatgaacaggctctagaacagcggccagaacaccaggcccgcatcgatcagtgcccagatggcagtaccgaccaggaacacggcatacagc < 2:387583‑M1/150‑150 (MQ=255) | CGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACC > NC_002947/4047687‑4047985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |