| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4047836 | 77 (1.290) | 8 (0.140) | 8/224 | NT | 9.9% | coding (343/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 4047845 | 73 (1.310) | coding (352/2418 nt) | quiA | quinate dehydrogenase | |||||
GGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCAAGGAA > NC_002947/4047696‑4047994 | ggCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACg < 2:187712/150‑1 (MQ=255)ggCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACg > 1:185459/1‑150 (MQ=255) gCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTAGAGCCTGTTCATGTACGACGGAAGCTGGGTGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGg < 2:387583‑M2/150‑2 (MQ=255) 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cGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAgcgc > 2:701556/1‑150 (MQ=255) gtTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCgccgg > 1:235070/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCcgc > 1:1337872/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGGCAGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCcgcg < 1:1565/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTACCAACGGCGCCAGCGCCGGCcgcg > 2:788940/1‑150 (MQ=255) 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ccAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAAc > 1:634298/1‑145 (MQ=255) ccAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCa > 1:1030734/1‑150 (MQ=255) ccAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCa < 1:914821/150‑1 (MQ=255) cAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCaa < 2:824505/150‑1 (MQ=255) aaCGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCAAg > 1:1194680/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCAAgg > 2:764096/1‑150 (MQ=255) ggCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCAAGGaa < 2:1280942/150‑1 (MQ=255) | GGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCGCCGGCCGCGGTGCCTACGGCGTCGCCGGGGTAATGGCCGTGGTACTGGTGGTCGCGGTCGGCAACATGTTCGTTGCTCACCCAAGCGTCGCGCCCACCGGCAAAGGCCCGGGCATGACCCCGGTCGAAACCGGCAAGGAA > NC_002947/4047696‑4047994 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |