New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1622527 = | 53 (0.890) | 16 (0.310) | 13/204 | NT | 28.6% | intergenic (+7/+59) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1622577 = | 35 (0.690) | intergenic (+57/+9) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
CGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGC > NC_002947/1622430‑1622724 | cGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTCGCCTGGGTAGCCCCTTTCATGGGCTCCCCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTgg < 1:376219/150‑1 (MQ=255) gagaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGt > 1:1628373/1‑150 (MQ=255) agaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTa < 2:1212242/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACa < 1:1367721/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGGCGCACCTGGCCCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAg < 1:146263/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTc > 1:717423/1‑150 (MQ=255) tCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCa < 2:717423/150‑1 (MQ=255) gcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCaa > 1:151873/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATAGGCTCACCCGGAAAAGGGGCGACA‑CAGGCTTGGACAGCTCATCGCAACa < 2:1252732/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACAt > 2:1422366/1‑150 (MQ=255) aCCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTcc > 1:437277/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcag > 2:446367/1‑150 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGTGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTc > 1:111694/1‑150 (MQ=255) gatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccagcctgtgtcgcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAgc > 1:1428781‑M2/96‑109 (MQ=255) gatgaactgctggaggcgcggagcatgttgcgctgagctgtaccagcctgtgtcgcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAgc < 2:1428781‑M2/14‑1 (MQ=255) gggTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCGGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCg > 1:539237/1‑150 (MQ=255) gggTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCg < 1:1607397/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCt > 1:964275/1‑114 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTCCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCt < 2:964275/114‑1 (MQ=255) gtgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc > 1:1326887/1‑150 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCATGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 1:678146/150‑1 (MQ=255) cgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGATCGGTGCAACACGGc < 2:437277/150‑1 (MQ=255) aGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAAcccc > 1:1243312/1‑150 (MQ=255) cTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCG‑CCCTTTCATTGGCTCCCCCGCGAAAAGGGCGACACCAGGC‑GGGAAAGCTCAACGCAACATGCTTCGCGCCTCCAGCAGTTTCACGACCTCCCGCTCGGGGCCCAACCGCAAACCCaaa > 2:1625669/1‑148 (MQ=255) ttATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGTCAACCCCAGAt > 2:1590627/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc < 2:314913/92‑1 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc > 1:314913/1‑92 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGc > 1:874873/1‑150 (MQ=255) gcgGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCgg > 2:818933/1‑150 (MQ=255) gctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 1:1428781‑M1/15‑109 (MQ=255) gctgagctgtaccaGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:1428781‑M1/95‑1 (MQ=255) aTTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 2:888871/1‑106 (MQ=255) aTTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 1:888871/106‑1 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGcc > 2:1614256/1‑148 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGcc < 1:1614256/148‑1 (MQ=255) aTGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCgg > 1:1228162/1‑150 (MQ=255) CTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGTCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGgcagcgcagc > 1:1590627‑M1/1‑150 (MQ=255) GTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAACGCAGCCAAt > 2:151873‑M1/1‑150 (MQ=255) CGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATgg < 2:825228‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGc < 2:607710‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGc > 1:1422366‑M1/1‑150 (MQ=255) gcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:941926‑M2/45‑1 (MQ=255) gcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 1:941926‑M2/42‑86 (MQ=255) gcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc < 2:952442‑M2/67‑1 (MQ=255) gcccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc > 1:952442‑M2/42‑108 (MQ=255) cgCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTAGAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGcc < 2:265084‑M1/148‑1 (MQ=255) cccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgagacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACgg < 2:1246966‑M2/69‑1 (MQ=255) cccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACgg > 1:1246966‑M2/41‑109 (MQ=255) cccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCaa < 1:1083059‑M2/105‑1 (MQ=255) cccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCaa > 2:1083059‑M2/41‑145 (MQ=255) cccctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGcc > 1:65200‑M2/41‑150 (MQ=255) cctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCgg > 1:92070‑M2/39‑150 (MQ=255) CTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCgg < 1:1464350‑M1/149‑1 (MQ=255) CTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCgg > 2:1464350‑M1/1‑149 (MQ=255) ctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc < 2:189343‑M2/25‑1 (MQ=255) ctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTc > 1:189343‑M2/38‑62 (MQ=255) TTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTg < 1:1396741‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGa > 2:874873‑M1/1‑150 (MQ=255) aTGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc > 1:853815/1‑77 (MQ=255) aTGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:853815/77‑1 (MQ=255) gcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGc > 2:1119139‑M2/33‑150 (MQ=255) gggCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGc > 1:69422/1‑100 (MQ=255) gggCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGc < 2:69422/100‑1 (MQ=255) gggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATAGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGccc > 1:1368441‑M2/31‑150 (MQ=255) gCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCcgc > 1:1361283/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctg > 1:1009592/1‑150 (MQ=255) cccGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctga < 1:818933/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAAc > 2:178954/1‑41 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAAc < 1:178954/41‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGAc > 1:1631034/1‑138 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGAc < 2:1631034/138‑1 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctgact > 2:1647850/1‑150 (MQ=255) ccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATAGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctgac < 2:1368441‑M2/128‑1 (MQ=255) gcgAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctgactg < 1:446367/150‑1 (MQ=255) aaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATg > 2:715921‑M2/18‑150 (MQ=255) aaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGc > 2:94083‑M2/17‑150 (MQ=255) gggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGc > 1:980137‑M2/14‑150 (MQ=255) gcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGAc < 2:403756‑M2/116‑1 (MQ=255) gcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGAc > 1:403756‑M2/12‑127 (MQ=255) gcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCgg < 2:1628373‑M2/139‑1 (MQ=255) cacaggcTGGTACAGCTCGGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGa > 1:213500‑M2/8‑150 (MQ=255) acaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 2:858142‑M2/68‑1 (MQ=255) acaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg > 1:858142‑M2/7‑74 (MQ=255) aggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCt > 1:1449725‑M2/5‑150 (MQ=255) gcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGc > 1:1473261‑M2/3‑150 (MQ=255) | CGAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATGGGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACA‑CAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGC > NC_002947/1622430‑1622724 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |