New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 227282 = | 93 (1.050) | 6 (0.070) | 6/242 | NT | 5.6% | coding (108/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter |
? | NC_002947 | 227306 = | 110 (1.280) | coding (132/2088 nt) | PP_0176 | putative efflux transporter |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTCGAGGCTGCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTGCAGTCAC > NC_002947/227137‑227430 | ttCGAGGCTGCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCcgc < 2:1615276/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGCTGCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCcgc < 1:1271091/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGCTGCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCAT‑AGGTTTTTCTTTAAGCTATTGTCCTCCCTCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCcgc > 2:671800/1‑150 (MQ=255) gCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACt > 1:1258927/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGc > 2:476725/1‑150 (MQ=255) ttggCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGAGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCAt > 2:1958536/3‑150 (MQ=255) ggCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATgg < 1:1717870/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCCGTCCCTCCGGCCAGTCACTGGTACTACGTCGTGCGCCGCTTCTGCGCGTCCACGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATgg < 2:2015947/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACg < 1:1197974/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGTCATGGCGACGgt > 2:67941/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGgt < 2:667359/150‑1 (MQ=255) gggTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCAGGCTCGAGGCTGTTTCTACGGCGTGCGCACCTTACGTGCTGCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACAt < 1:1684597/150‑1 (MQ=255) ggCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGtc < 2:801243/150‑1 (MQ=255) aTGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTcc < 1:551781/150‑1 (MQ=255) aaCGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGc > 2:1372870/1‑150 (MQ=255) aCGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGgt < 2:458096/133‑1 (MQ=255) aCGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGgt > 1:458096/1‑133 (MQ=255) ggTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATg < 1:1712975/123‑1 (MQ=255) ggTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATg > 2:1712975/1‑123 (MQ=255) ggTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGcccc < 2:1383315/150‑1 (MQ=255) aGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGc > 2:1909103/1‑150 (MQ=255) tctGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCCCCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCg > 2:221652/1‑150 (MQ=255) tctGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTtc > 1:2153728/1‑141 (MQ=255) tGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGAc < 1:476725/150‑1 (MQ=255) ccTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGc > 2:2177366/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGAc > 1:100051/1‑145 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGAc < 2:100051/145‑1 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCt > 2:398262/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCt > 1:970751/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCt > 1:1000151/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGACGCATTCATTCTGGGCCATGGCGGCGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCt > 1:753502/1‑150 (MQ=255) gCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAg < 2:1000151/150‑1 (MQ=255) gCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAg > 1:133774/1‑150 (MQ=255) ccGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGc > 2:2199670/1‑150 (MQ=255) cGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCg > 2:1447511/1‑150 (MQ=255) cGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCg > 2:622429/1‑150 (MQ=255) gTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGt > 1:172187/1‑150 (MQ=255) tGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGtt < 2:172187/150‑1 (MQ=255) aCTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGgtg > 1:1297155/1‑101 (MQ=255) cTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCAAGATTGCCCTGTATATTGCACCTCTGATGCAACTGCCGTGTCCCTACTGGGCAATGGCGACGGAGAACAAGGTTACCAGCCACTTCGTCGGCCAGAACAGCAAGAAGGCGTtata > 2:324562/1‑150 (MQ=255) tGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCGTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAc > 2:783488/1‑150 (MQ=255) tGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAc > 1:549308/1‑150 (MQ=255) cgacggcacggtacaacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATc < 1:616006‑M1/37‑1 (MQ=255) cgacggcacggtacaacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATc > 2:616006‑M1/69‑105 (MQ=255) gTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCg > 2:1780103/1‑150 (MQ=255) gTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGGCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCg > 2:2132033/1‑150 (MQ=255) ttCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGt > 1:876639/1‑150 (MQ=255) tACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCGCGCACTTCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGcc < 1:1755021/150‑1 (MQ=255) tACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGtc > 1:20327/1‑102 (MQ=255) tACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGtc < 2:20327/102‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGt < 1:1958536/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGt > 2:1211718/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGTCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTc < 1:67941/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATATTAACTGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTc > 1:146086/1‑150 (MQ=255) gtacaacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATgg > 1:198326‑M1/59‑81 (MQ=255) gtacaacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATgg < 2:198326‑M1/23‑1 (MQ=255) gCGTGCGCACCTTCGGCGCGTACATGAGTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCg > 2:797058/1‑150 (MQ=255) caacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGAc > 2:1018651‑M1/56‑82 (MQ=255) caacgccttggagctggtcgggccgacgaaggggctggagacgatgtacaccgtcGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGAc < 1:1018651‑M1/27‑1 (MQ=255) gcgcACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATACTGGAGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCAc < 1:1192128/150‑1 (MQ=255) cGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCgg < 1:221652/150‑1 (MQ=255) gTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTgg < 2:1333122/150‑1 (MQ=255) cATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCgg > 2:838220/1‑150 (MQ=255) cATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTCGCgg < 2:1258927/150‑1 (MQ=255) aTGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTCCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCggg < 1:2177366/150‑1 (MQ=255) aTGATTGCCCCGTACACTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCTTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCggg < 1:498134/150‑1 (MQ=255) gATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGc < 2:1956183/150‑1 (MQ=255) ttGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTGTCCAGCCCCTTCCTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCaa > 2:1240874/1‑150 (MQ=255) cccTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCt > 2:1595820/1‑150 (MQ=255) ccTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCtt > 1:2174776/1‑150 (MQ=255) cTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAcc > 1:2319004/1‑109 (MQ=255) cTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAcc < 2:2319004/109‑1 (MQ=255) cTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTc > 1:751159/1‑150 (MQ=255) gTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCt < 1:173335/150‑1 (MQ=255) cATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGt < 2:1117977/150‑1 (MQ=255) aTTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAc > 2:1077214/1‑102 (MQ=255) aTTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTAc < 1:1077214/102‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCgggg > 2:1078215/1‑133 (MQ=255) gCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCgggg < 1:1078215/133‑1 (MQ=255) cccTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTgccgc > 2:729318/1‑150 (MQ=255) cccTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTgccgc < 1:1447511/150‑1 (MQ=255) ccTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTgccgcc > 2:727474/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTgccgcc < 2:2174776/150‑1 (MQ=255) cTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGt < 1:1426897/91‑1 (MQ=255) cTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGt > 2:1426897/1‑91 (MQ=255) cTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGccgccg > 1:297880/1‑150 (MQ=255) cTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCGCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTg < 2:1940240/150‑1 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTg > 1:1557110/1‑94 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTg < 2:1557110/94‑1 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGt < 1:1979976/98‑1 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGt > 2:1979976/1‑98 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTg < 1:398262/150‑1 (MQ=255) aTGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTg > 1:1026019/1‑150 (MQ=255) cAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTGCAg < 1:727474/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGAc < 2:1603229/67‑1 (MQ=255) aaCTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGAc > 1:1603229/1‑67 (MQ=255) aaCTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGc > 1:270713/1‑71 (MQ=255) aaCTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGc < 2:270713/71‑1 (MQ=255) cTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTGCAGTCa > 2:265589/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTGCAGTCAc > 2:1827197/1‑150 (MQ=255) | TTCGAGGCTGCCGGCCTGGGCAGCGCAGGCGGGGTGGCATGAACGGTTTC‑TTCAGCTCTGTCCCTCCGGCCCGTGACTGGTTCTACGGCGTGCGCACCTTCGGCGCGTCCATGATTGCCCTGTACATTGCCCTGCTCATGCAACTGCCGCGTCCCTACTGGGCCATGGCGACGGTGTACATCGTCTCCAGCCCCTTCGTCGGCCCGACCAGCTCCAAGGCGTTGTACCGTGCCGTCGGCACGTTGCTCGGCGCTGGCGGGGCAATCTTCCTGGTGCCGCCGCTGGTGCAGTCAC > NC_002947/227137‑227430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |