| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 394356 | 61 (0.690) | 4 (0.060) | 4/198 | NT | 6.3% | intergenic (+36/‑266) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 394400 | 70 (1.000) | intergenic (+80/‑222) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CTGATTGCCAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTC > NC_002947/394213‑394500 | cTGATTGCCAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAg > 1:840179/1‑150 (MQ=255) aaaGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCttacgggggaccgca > 1:2190325‑M1/1‑135 (MQ=255) aaGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcaca < 1:1567943/150‑1 (MQ=255) aaGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCGCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTacagcaca < 2:810836/150‑1 (MQ=255) gATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCgg > 1:2334750/1‑150 (MQ=255) atCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACCTCGCACGACGGTTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGtt < 2:510338/150‑1 (MQ=255) ccTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCCGGTTGGTGCGGt > 1:897080/1‑150 (MQ=255) cTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTc > 1:2235363/1‑150 (MQ=255) tGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAg < 2:203027/119‑1 (MQ=255) tGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTcc > 1:329842/1‑150 (MQ=255) cATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTccccc < 2:2235363/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGt < 1:1054136/144‑1 (MQ=255) gggcggTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAg > 1:2288494/1‑107 (MQ=255) gggcggTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAg < 2:2288494/107‑1 (MQ=255) 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2:1404303/1‑119 (MQ=255) cgGCTAAAGCCGCTCttacgggtgaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgatac < 2:153331‑M1/150‑136 (MQ=255) cgGCTAAAGCCGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgatac < 2:586442‑M1/150‑136 (MQ=255) ggCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCAtctctc < 1:2075572/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATctctct < 1:1560243/150‑1 (MQ=255) gCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATctctct > 2:2226569/1‑150 (MQ=255) tAAAGCCGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcag < 2:2193803‑M1/121‑111 (MQ=255) aaaGCCGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgataccccac > 2:953173‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTc > 1:1343731/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgaca > 2:2125831‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgaca < 1:2125831‑M1/100‑94 (MQ=255) gCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgataccccaccgc < 2:2190325‑M2/150‑100 (MQ=255) gCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCt > 1:291155/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCt > 1:38293/1‑150 (MQ=255) ccGCTCttacgggggaccgcaccaagagataggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgataccccaccgcc > 1:1229520‑M1/1‑6 (MQ=255) cGCTCttacgggggaccgcaccaacccgagggctgtgctgtacctgtaggagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgatacc < 1:2187260‑M1/141‑137 (MQ=255) gCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGac < 2:657903/114‑1 (MQ=255) gCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGac > 1:657903/1‑114 (MQ=255) cTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttg > 2:440578‑M2/1‑47 (MQ=255) cTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttg < 1:440578‑M2/105‑59 (MQ=255) tCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaa < 1:160175‑M2/65‑20 (MQ=255) | CTGATTGCCAAAGGGCGGGATATCGAATGCCTGACATTGGCGCGGGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTC > NC_002947/394213‑394500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |