| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 394356 | 61 (0.690) | 4 (0.060) | 4/198 | NT | 6.3% | intergenic (+36/‑266) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 394400 | 70 (1.000) | intergenic (+80/‑222) | purU‑I/fdhA | formyltetrahydrofolate deformylase/formaldehyde dehydrogenase | |||||
GGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTCCCTCATTCCAG > NC_002947/394257‑394548 | ggcggTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCTATCTCTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcgg > 1:1229520‑M2/1‑144 (MQ=255) gTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggcttt > 2:953173‑M2/1‑140 (MQ=255) ggTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcg < 1:2187260‑M2/141‑6 (MQ=255) ggTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcg > 2:2187260‑M2/1‑136 (MQ=255) gTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccg < 2:586442‑M2/150‑16 (MQ=255) gTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCACCCGTAAgagcggctttagccg < 2:153331‑M2/150‑16 (MQ=255) agcacagcGGGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcg > 2:840179‑M2/3‑133 (MQ=255) tcaTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGACCAAGCCGCACCTACAGACACAGCACAGCGCGCTGTTGTGGGCGTTCTGCCGGAAGAGCGGCTCGAGCCGCGAag > 1:2089443/2‑150 (MQ=255) caTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaaga < 1:197691‑M2/150‑22 (MQ=255) aTCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagag < 2:2304632‑M2/150‑23 (MQ=255) aTCGAGCGACGGGGGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagag < 2:1560243‑M2/150‑23 (MQ=255) gAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGATCCTACAGGTACAGCACAGCCCGCGGGTTAGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagaggcc < 2:926130‑M2/150‑26 (MQ=255) gACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCCGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCTCTCGGGATGGTTCGGTCCCCCGTGACAGCGGCTTTAGCCGCGAACAGGCCCGca > 2:786041/1‑150 (MQ=255) ttCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAACGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCTCACAGgccgc > 1:1062324/1‑150 (MQ=255) ccTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACACCCCTCGGGTTGGTGCGATCCCCCGTAAGAGCGGCTGTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGaccaccc > 2:478727/1‑149 (MQ=255) cTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggcttta < 2:2193803‑M2/121‑12 (MQ=255) cTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggcttta > 1:2193803‑M2/1‑110 (MQ=255) cTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctc > 2:1980453/1‑150 (MQ=255) cTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCGAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTATCCGCGAAGAGGCCCGCACCGGCCGCctc > 2:117011/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctctct < 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aCTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATAc > 1:1985875/1‑150 (MQ=255) tGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggc < 1:2125831‑M2/100‑8 (MQ=255) tGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAgagcggc > 2:2125831‑M2/1‑93 (MQ=255) gTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGca > 2:182946/1‑113 (MQ=255) gTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGca < 1:182946/113‑1 (MQ=255) aataaCCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGTTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTGCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGacac < 1:153331/150‑1 (MQ=255) ccGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTg > 1:353542/1‑150 (MQ=255) ccGGTACCGGCCTCTTAGCGGCTACAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTg > 1:53180/1‑150 (MQ=255) cGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGcc < 1:207509/126‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCCTCTTCGCAGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGcc > 2:207509/1‑126 (MQ=255) ggTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGcc < 2:353542/150‑1 (MQ=255) ggTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGcc < 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cTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATcc > 2:233111/1‑150 (MQ=255) tCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctctct < 1:2076913/67‑1 (MQ=255) tCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCctctct > 2:2076913/1‑67 (MQ=255) tCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCg > 1:1901723/1‑150 (MQ=255) ggTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGcc > 2:532546/1‑150 (MQ=255) ggTTCGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGcc < 1:586442/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGccc < 2:329842/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGccc > 2:2107325/1‑150 (MQ=255) gTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTc < 1:48802/116‑1 (MQ=255) gTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTc > 2:48802/1‑116 (MQ=255) gTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACaa < 2:291155/150‑1 (MQ=255) tGCGGTCCCCCGTAAgagcggctttagccgcgaagaggccggtaccggttattacagaacgacagtccggttggcgttcaggaacacccgtcgctcgatgtgataccccaccgcccgcgccaatgtcaggcattcgatatcccgcccttt > 1:2190325‑M2/1‑15 (MQ=255) tGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGc > 2:1476433/1‑113 (MQ=255) tGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGc < 1:1476433/113‑1 (MQ=255) tGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAAt > 2:1758786/1‑150 (MQ=255) ggTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTcc < 2:897080/150‑1 (MQ=255) gTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTccc < 2:2334750/150‑1 (MQ=255) gTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTccc > 1:425037/1‑150 (MQ=255) cccccGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTCCCTc < 1:233111/150‑1 (MQ=255) aaGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACTAGTCCCTCGTTCCAg < 2:2089443/150‑1 (MQ=255) aaGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTccc < 2:606416/141‑1 (MQ=255) aaGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTccc > 1:606416/1‑141 (MQ=255) | GGCGGTGGGGTATCACATCGAGCGACGGGTGTTCCTGAACGCCAACCGGACTGTCGTTCTGTAATAACCGGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCGCTCCTACAGGTACAGCACAGCCCTCGGGTTGGTGCGGTCCCCCGTAAGAGCGGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCCGCCTCTCTGTTTGCCCATACTCCCCAGCGACACCCCTGCCGTTAAAAGGCATCTCTCTGTCGCTCCCAGTCAGTGCAGATCTCCCCATCCGGCCCACAATTCCCTCATTCCAG > NC_002947/394257‑394548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |