New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1465319 = | 83 (0.940) | 6 (0.070) | 6/240 | NT | 6.8% | coding (306/1440 nt) | algX | alginate biosynthesis protein AlgX |
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GCACGTTGTAACCCATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGC > NC_002947/1465171‑1465467 | gCACGTTGTAACCCATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTcca > 2:112782/1‑150 (MQ=255) cacgatgcaagccgctacaccacccgctatcagcaaaacttcaccacgctggtgcaggcccagggcgactggctgttccgcacccgcgaagacctgcgcaccgagttcaacaccaccccagccggatacaaacgcctgcagcaagtgCAc < 1:542384‑M1/3‑1 (MQ=255) aagccgctacaccacccgctatcagcaaaacttcaccacgctggtgcaggcccagggcgactggctgttccgcacccgcgaagacctgcgcaccgagttcaacaccaccccagccggctacaaacgcctgcagcaagtgCACGCCACGtt < 2:2205514‑M1/11‑1 (MQ=255) cccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTc > 1:1035594/1‑150 (MQ=255) cccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTc < 2:227559/150‑1 (MQ=255) ccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCTCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCt > 2:2129229/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACGACCAGTTCCACGCCACGTTTCt > 1:1870729/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCt > 1:510441/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCt > 2:1916286/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCt > 1:947705/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGaa < 1:1292232/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGaa < 1:1316199/150‑1 (MQ=255) accacccgctatcagcaaaacttcaccacgctggtgcaggcccagggcgactggctgttccgcacccgcgaagacctgcgcaccgagttcaacaccaccccagccggctacaaacgcctgcagcaagtgCACGCCACGTTTCTTGAAcgc < 1:1507642‑M1/21‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) accaccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCgtg > 2:1988318/1‑141 (MQ=255) accaccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCgtg < 1:1988318/141‑1 (MQ=255) accaccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGttt > 2:258327/1‑150 (MQ=255) caccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGgtgt < 2:73294/74‑1 (MQ=255) caccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGgtgt > 1:73294/1‑74 (MQ=255) accaGTTCCACGCCACGTTTCTTAAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGc > 2:1210349/1‑150 (MQ=255) ccaGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCt < 1:1143286/150‑1 (MQ=255) caGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACa < 2:1139829/107‑1 (MQ=255) caGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACa > 1:1139829/1‑107 (MQ=255) ccacgccacgTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGc < 2:1972385/150‑1 (MQ=255) | GCACGTTGTAACCCATGCTGGCGAAGCGCTTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGC > NC_002947/1465171‑1465467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |