| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1465319 = | 83 (0.940) | 6 (0.070) | 6/240 | NT | 6.8% | coding (306/1440 nt) | algX | alginate biosynthesis protein AlgX |
| ? | NC_002947 | 1465346 = | 84 (0.980) | coding (279/1440 nt) | algX | alginate biosynthesis protein AlgX | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCTTGCATCGTGCGC > NC_002947/1465200‑1465495 | ttGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACt < 2:87453/150‑1 (MQ=255) aaaacttcaccacgctggtgcaggcccagggcgactggctgttccgcacccgcgaagacctgcgcaccgagttcaacaccaccccagccggctacaaacgcctgcagcaagtgCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTtgctgc > 1:2205514‑M1/114‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTtgctgc > 1:1188523/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTtgctgc > 2:1059266/1‑150 (MQ=255) ctagTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCg < 1:102812/147‑1 (MQ=255) tGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGt > 1:664825/1‑150 (MQ=255) tGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGt > 1:429817/1‑150 (MQ=255) tGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTCCCGCCGGGTTGAGCAAGTTGCCGTTCAACAGGCCGCGTGTCGGCTGGTACACCACCACCTGTGCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGt < 2:2016467/150‑1 (MQ=255) gggTATTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGt < 2:864350/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTa < 2:1035594/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAg > 1:882286/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGcc < 1:2307454/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTgg > 2:1439659/1‑150 (MQ=255) gCCTTCTGGCAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTggg < 1:99833/150‑1 (MQ=255) ccTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCGGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGGGGGTACACCACCACCAGTGCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTgggg < 2:663845/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTATCCGGCTGGggtg > 2:542384/1‑150 (MQ=255) cTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCTCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGggtggt < 1:2129229/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGggtggt > 2:895159/1‑150 (MQ=255) 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tttttCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAg < 1:1439659/150‑1 (MQ=255) tttttCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAg < 2:947705/150‑1 (MQ=255) tttttCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAg > 2:274203/1‑150 (MQ=255) gccgGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGaa > 2:350746/1‑131 (MQ=255) gccgGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGaa < 1:350746/131‑1 (MQ=255) gggTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCgg < 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ccacgTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGggtg < 2:1426530/150‑1 (MQ=255) ccacgTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCCTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGggtg < 1:306852/150‑1 (MQ=255) gcgttcaagaaacgtggcgtgCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGggtggt < 1:1507642‑M2/129‑1 (MQ=255) acgTTTCTTGAACGCGTCGTGCTCTTGAAGCAGGCGTTTGTCGCCGGGTTGTGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGggtggt < 2:510441/150‑1 (MQ=255) cTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCg < 1:1830301/150‑1 (MQ=255) ttGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGc > 2:2247197/1‑136 (MQ=255) ttGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGc < 1:2247197/136‑1 (MQ=255) ttGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGATGATAGCGGGGGGTGTAggtg > 2:1882352/1‑147 (MQ=255) ttGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGGCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCGGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCgg > 2:492179/1‑150 (MQ=255) ttGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGAGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCgg > 2:1695892/1‑150 (MQ=255) tGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCgg > 1:1096910/1‑77 (MQ=255) tGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCgg < 2:1096910/77‑1 (MQ=255) aacgtggcgtgCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCtt < 2:2205514‑M2/139‑1 (MQ=255) aaCGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCtt < 2:882286/150‑1 (MQ=255) aaCGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCtt < 1:895159/150‑1 (MQ=255) gtcgtGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCTTGCATc < 1:884451/150‑1 (MQ=255) gtgCACTTGCTGCAGGCGTTTGTATCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCTTGCATCGTg < 1:542384‑M2/147‑1 (MQ=255) gtgCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGc > 2:366517‑M2/4‑103 (MQ=255) gtgCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGc < 1:366517‑M2/100‑1 (MQ=255) cACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCTTGCAGCGTgcgc < 2:1574429/150‑1 (MQ=255) | TTGAGCATGGCCTGGTAGTTGCCCAGGGCCTTCTGGTAGTCGAACGCGGCTTTTTCCGCCGGGTTGAGCATGTTGCGGTTCACCAGGCCGCGGGTCGGCTGGTACACCACCACCAGTTCCACGCCACGTTTCTTGAACGCGTCGTGCACTTGCTGCAGGCGTTTGTAGCCGGCTGGGGTGGTGTTGAACTCGGTGCGCAGGTCTTCGCGGGTGCGGAACAGCCAGTCGCCCTGGGCCTGCACCAGCGTGGTGAAGTTTTGCTGATAGCGGGTGGTGTAGCGGCTTGCATCGTGCGC > NC_002947/1465200‑1465495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |