| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1480639 = | 86 (0.970) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.2% | coding (1106/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| ? | NC_002947 | 1480673 = | 65 (0.770) | coding (1072/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TTCCGGCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCA > NC_002947/1480491‑1480783 | ttCCGGCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAg > 1:2054418/1‑150 (MQ=255)gtggccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAg > 1:1148665‑M1/149‑150 (MQ=255) tggccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGc > 1:1009128‑M1/148‑150 (MQ=255) gccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTg > 2:1319576‑M1/146‑150 (MQ=255) gccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTg > 2:1715982‑M1/146‑150 (MQ=255) ggCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTgg < 1:1988809/150‑1 (MQ=255) ccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTgg > 1:1578609‑M1/145‑150 (MQ=255) ccagcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTgg < 1:1878818‑M1/6‑1 (MQ=255) gCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTggg > 1:794112/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTggg > 1:2086455/1‑150 (MQ=255) agcgaaacggtggagcagcacgtgtatgcggtggccggcagcgacaagtacaaactgttgtacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaagctcgta < 2:441785‑M1/8‑5 (MQ=255) ggTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGc > 2:1313927/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTTGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCa > 1:1156088/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCAt < 2:2086455/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCAt < 2:1400920/150‑1 (MQ=255) gAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCAtt < 1:493670/150‑1 (MQ=255) gAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCAtt < 2:647603/150‑1 (MQ=255) ttGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATa > 2:1694209/1‑150 (MQ=255) cTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTAcc > 1:441785/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCt > 1:1924960/1‑150 (MQ=255) ccATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCttt > 1:749556/1‑150 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt < 1:461639/149‑1 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt > 2:461639/1‑149 (MQ=255) 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aCGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTATCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTg > 1:1171455/1‑150 (MQ=255) cGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGc < 2:2054418/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCgg < 1:1974843/150‑1 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc < 2:1206879‑M1/41‑1 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc > 1:1206879‑M1/83‑123 (MQ=255) ggTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt < 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tttGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGttt < 2:645362/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTa < 1:1024122/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTa < 1:2072622/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtt > 2:441336/1‑56 (MQ=255) tgctgcGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtt < 1:441336/56‑1 (MQ=255) gctgcGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCa > 1:96945/1‑102 (MQ=255) gctgcGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCa < 2:96945/102‑1 (MQ=255) gctgcGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACt > 2:1862642/1‑150 (MQ=255) cGGCACGTCGCCCGGGAGCGGGGGCGGAGTGGTAGCGTGGCGTGCGAGGTTTTCCTGGATGCGCCGCGCTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTc < 2:475912/150‑1 (MQ=255) cGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTc > 1:2284295/1‑150 (MQ=255) cACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGc > 1:971647/1‑149 (MQ=255) cACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGc < 2:971647/149‑1 (MQ=255) gTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGcc > 1:773158/1‑150 (MQ=255) tCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCg < 1:1320867/150‑1 (MQ=255) cccGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGcc > 2:1129211/1‑150 (MQ=255) ccGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGt < 2:2212204/117‑1 (MQ=255) ccGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGt > 1:2212204/1‑117 (MQ=255) ccGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCGGGccc > 1:817508/1‑149 (MQ=255) | TTCCGGCAGGGTGAAGTTGATCACGTGGCTGATGCCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCA > NC_002947/1480491‑1480783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |