| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1480639 = | 86 (0.970) | 4 (0.050) | 4/236 | NT | 5.2% | coding (1106/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| ? | NC_002947 | 1480673 = | 65 (0.770) | coding (1072/1443 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB | |||||
CCATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGTACAACAGTTTGTACTTGTCGCTGCCGGCCACCGCATACACGTGCTGCTCCACCGTTTCGCTGGCCAC > NC_002947/1480525‑1480820 | ccATCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCttt > 1:749556/1‑150 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt < 1:461639/149‑1 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCtttt > 2:461639/1‑149 (MQ=255) aTCGATATGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTc < 2:1077939/150‑1 (MQ=255) atGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTTGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAt < 1:1334865/150‑1 (MQ=255) atGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAt > 2:2072622/1‑150 (MQ=255) tGGATCCCACGCCCGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTcttgtatg > 2:1919423/1‑143 (MQ=255) aTCCCCCGCCCGGCCACGGCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCCCCCTTCGCCGGAGCTCTTCAGGGTCCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATgcgc < 1:1665016/150‑1 (MQ=255) cccGGCCACGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTc < 1:1514572/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTATCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTg > 1:1171455/1‑150 (MQ=255) cGTCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGc < 2:2054418/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCgg < 1:1974843/150‑1 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc > 1:1206879‑M1/83‑123 (MQ=255) tacaacctggtgacccagaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTc < 2:1206879‑M1/41‑1 (MQ=255) ggTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt < 1:1313927/150‑1 (MQ=255) gTGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGAGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGCGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGAAGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGttt > 1:177786/1‑149 (MQ=255) tGGCGACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTgg < 2:794112/150‑1 (MQ=255) gACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt > 1:545179/1‑144 (MQ=255) gACCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGtt < 2:545179/144‑1 (MQ=255) aCCAACACGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAac > 1:1474405/1‑150 (MQ=255) acacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGATTTGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCa > 2:1374552/1‑150 (MQ=255) cacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCAt > 2:1445823/1‑150 (MQ=255) cacGGTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCAt > 1:645362/1‑150 (MQ=255) ggTGATGCGCCCTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCAc < 1:977459/150‑1 (MQ=255) agaacaagtgggaacgggtgatggtgttcgccaaccgcaaggacgaagtgcggcgcatcgaggaaaAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTc < 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ccTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCAc < 1:1988661/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACt > 2:1878818/1‑150 (MQ=255) ttCGCGTAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt > 1:1460718/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGTCGCAGCATGACCGGCGCGGACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACtt < 2:777669/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGc > 1:428280/1‑126 (MQ=255) ttCGCGGAAGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGc < 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aaGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGCTACCCTCTCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTgg < 1:1694209/150‑1 (MQ=255) aaGCTCTCCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGGGCTgg < 1:1374552/150‑1 (MQ=255) tcCAGGGTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCAcc > 2:1168415/1‑150 (MQ=255) ggTTCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGtt < 1:1501299/150‑1 (MQ=255) ttCGGATGCGTTTGTGCTGCGGCACGTCGCCCGACAGCTGGGCCGCATTGATACCGTCGCGTACCAGCTTTTCCTCGATGCGCCGCACTTCGTCCTTGCGGTTGGCGAACACCATCACCCGTTCCCACTTGTTCTGGGTCACCAGGTTGt > 1:371372/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |