| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2954698 | 59 (0.670) | 5 (0.070) | 5/200 | NT | 9.2% | intergenic (‑158/‑123) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 2954716 | 51 (0.720) | intergenic (‑176/‑105) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACA > NC_002947/2954549‑2954846 | ccTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGC < 2:2050453‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCg > 1:394908/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCg < 2:1250621/150‑1 (MQ=255) tgaaccgggATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCgg > 1:796389/7‑150 (MQ=255) tGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGTGTGAGCgg > 2:2296914/1‑150 (MQ=255) tGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCgg > 2:925695/1‑150 (MQ=255) tGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGATGACAGGTGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCgg > 1:1194870/1‑150 (MQ=255) ggATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGc < 2:761809/150‑1 (MQ=255) tGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGTAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggct > 2:2324912‑M1/1‑138 (MQ=255) gCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCtt > 1:915197/1‑150 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGc < 2:2305666/150‑1 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGc < 2:394908/150‑1 (MQ=255) gACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGcc > 1:1275980/1‑143 (MQ=255) gACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGcc < 2:1275980/143‑1 (MQ=255) cctgcggcaGGCGCCCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGCAAAGCTCGCAGCTCTGGGGCGGGTTTTTGGGCGCACACCCTGCAGGCAGCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGTGGACACAGCCCTTGCCCGgc > 2:764600‑M2/4‑148 (MQ=255) cgGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcac < 1:579113‑M1/150‑25 (MQ=255) ggCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaa < 1:1534415‑M2/150‑12 (MQ=255) gCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGTAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaa < 1:2324912‑M1/150‑31 (MQ=255) gCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaa > 2:2254431‑M2/1‑138 (MQ=255) gCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaagggt < 2:223273‑M2/150‑17 (MQ=255) gCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcacaccaaagggt > 2:915197‑M2/1‑134 (MQ=255) cTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGTGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaagggtgattc > 1:2296914‑M2/1‑129 (MQ=255) tCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaagggtgattcc < 2:2098527‑M2/150‑23 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGt < 1:940120/150‑1 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGt < 1:2013072/150‑1 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGt < 1:2098527/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGc > 1:1026525/1‑150 (MQ=255) tgttgtGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAgcgc > 2:1112804/1‑150 (MQ=255) gtgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTg < 1:223273/150‑1 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGcc > 2:1064781/1‑137 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGcc < 1:1064781/137‑1 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTgg > 2:547490/1‑150 (MQ=255) tgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTgg < 1:547490/150‑1 (MQ=255) gCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGGTGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGc < 1:1780583/135‑1 (MQ=255) gCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGc > 2:1780583/1‑135 (MQ=255) gCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTggg < 1:1487608/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaagggtgattc > 1:2134976‑M2/1‑106 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGgctcaccccaaagggtgattc < 2:2134976‑M2/127‑22 (MQ=255) gaggTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGTACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTAt < 1:1184397/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCCGGCAACCGGAATCACCCTTGGGGTGGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTg > 1:1452392/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTg > 1:402464/1‑150 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCg > 2:1858995/1‑80 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCg < 1:1858995/80‑1 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagg > 2:1886795‑M1/1‑79 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagg < 1:1886795‑M1/111‑33 (MQ=255) gAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGa < 1:1179833/82‑1 (MQ=255) 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aGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgcaccgcac < 2:1026525/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGc < 1:1985207/100‑1 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGc > 2:1985207/1‑100 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGCACCGGTTCAACGACGCACCGCACTGGcggcgg > 1:2177/1‑150 (MQ=255) gggTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGCGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGAGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCCGTg < 1:650654/150‑1 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGt > 1:651376/1‑93 (MQ=255) ttGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGt < 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aaTCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACcaa < 1:925695/150‑1 (MQ=255) tCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTAGAGTGACcaatc > 2:1067967/1‑150 (MQ=255) aCCCTTTGGTGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagctttccgctcgacctccttgcacaacacctgacggtcgcgagcctgc > 2:915197‑M1/1‑16 (MQ=255) aCCCTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcgagctttccgctcgacctccttgcacaacacctgacggtcgcgagcctgc < 2:223273‑M1/150‑135 (MQ=255) cccTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaaa > 1:1028529/1‑124 (MQ=255) ccTTTGGGGTGAGCcgggcaagggctgtgtccgctcaccccaaagggtgattccgggtgcctgcagggtgtgggagcatcaacccgccccagcgctgcga > 2:1678633‑M1/1‑14 (MQ=255) 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CCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACA > NC_002947/2954549‑2954846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |