New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3538251 = | 75 (0.850) | 4 (0.050) | 4/232 | NT | 6.0% | coding (30/1116 nt) | PP_5587 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3538275 = | 56 (0.680) | coding (54/1116 nt) | PP_5587 | hypothetical protein |
AGATCCTGCCCGTGCGATATAAGGACCTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATC > NC_002947/3538103‑3538395 | agtgccgatcagggtgtaatccggcgcgataatagtgcgcgttatacccttttcccccgaggtcaacagcaatgggttgctgtcgaattcgacggatgtcggtaccaccaccgtagactgccaatttgccgccagtaccgcgtccgtgaa > 2:758184‑M1/149‑150 (MQ=255) gtgccgatcagggtgtaatccggcgcgataatagtgcgcgttatacccttttcccccgaggtcaacagcaatgggttgctgtcgaattcgacggatgtcggtaccaccaccgtagactgccaatttgccgccagtaccgcgtccgtgAAc < 2:1853873‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgccgatcagggtgtaatccggcgcgataatagtgcgcgttatacccttttcccccgaggtcaacagcaatggggcactgtcgaattcgacggatgtcggtaccaccaccgtagactgccaatttgccgccagtaccgcgtccgtgAAc > 1:2034487‑M1/148‑150 (MQ=255) 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aTGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGaa > 2:2048235/1‑150 (MQ=255) ccTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAAtt < 2:727613/113‑1 (MQ=255) ccTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAAtt > 1:727613/1‑113 (MQ=255) cttcttAGAACACCTCGCATTGCAACGGCGATCTTTTTCTGTCCGTTCACGGACGCGGTACTGGATGCCGACGATCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGt < 1:1572036/150‑1 (MQ=255) ttcttAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACggtggt < 2:1387340/88‑1 (MQ=255) ttcttAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACggtggt > 1:1387340/1‑88 (MQ=255) ttcttAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAgg < 2:461685/147‑1 (MQ=255) ttcttAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAgg > 1:461685/1‑147 (MQ=255) aacTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCAc > 2:325450/1‑150 (MQ=255) cTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACta < 1:2202967/150‑1 (MQ=255) cATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACtattat < 1:2048235/150‑1 (MQ=255) aTTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATc < 2:1720102/150‑1 (MQ=255) aTTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATc > 2:161260/1‑150 (MQ=255) AACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACAt < 2:1584842‑M1/77‑1 (MQ=255) AACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACAt > 1:1584842‑M1/1‑77 (MQ=255) | AGATCCTGCCCGTGCGATATAAGGACCTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATC > NC_002947/3538103‑3538395 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |