| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3538251 = | 75 (0.850) | 4 (0.050) | 4/232 | NT | 6.0% | coding (30/1116 nt) | PP_5587 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 3538275 = | 56 (0.680) | coding (54/1116 nt) | PP_5587 | hypothetical protein | |||||
GACCTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACACCCTGATCGGCACT > NC_002947/3538126‑3538422 | gACCTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTc > 1:1853873/1‑150 (MQ=255) cagaggTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCa > 1:81119/5‑150 (MQ=255) ccTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCAc < 1:1977338/150‑1 (MQ=255) cTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACg > 2:1443803/1‑150 (MQ=255) cTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACg > 1:236718/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGt > 2:1242924/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGt < 1:331125/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGt > 2:331125/1‑150 (MQ=255) gggCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTa < 2:236718/150‑1 (MQ=255) gggACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTgg < 1:1089761/150‑1 (MQ=255) aCATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTggcgg > 1:441833/1‑150 (MQ=255) aTGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCgg < 1:759910/139‑1 (MQ=255) aTGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCgg > 2:759910/1‑139 (MQ=255) 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2:1584842‑M1/77‑1 (MQ=255) AACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACAt > 1:1584842‑M1/1‑77 (MQ=255) GGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAg > 1:748154‑M1/1‑90 (MQ=255) GGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAg < 2:748154‑M1/90‑1 (MQ=255) GGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGa < 2:1520819‑M1/150‑1 (MQ=255) AATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAgg < 2:1851480‑M1/119‑1 (MQ=255) AATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAgg > 1:1851480‑M1/1‑119 (MQ=255) ATCTTGGGCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTAc > 1:132044‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACAcc > 1:972829/1‑150 (MQ=255) tGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACAccc < 2:2263834/150‑1 (MQ=255) tCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACACCCTGa > 1:311378/1‑150 (MQ=255) tCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCAGCGAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACACCCTGa > 1:62197/1‑150 (MQ=255) 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GACCTGGTGTCTGGGCGGGACATGTCCACCAACATCCAACTTCAGGCTGGCGATACGCTGGTCGTTCCTTGATCTTGCCTTTAATAAGAACATTTAATGCCTCTTCTTAGAACAACTCGCATTGCAACGGCAATCTTGGTCTTGCCGTTCACGGACGCGGTACTGGCGGCAAATTGGCAGTCTACGGTGGTGGTACCGACATCCGTCGAATTCGACAGCAACCCATTGCTGTTGACCTCGGGGGAAAAGGGTATAACGCGCACTATTATCGCGCCGGATTACACCCTGATCGGCACT > NC_002947/3538126‑3538422 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |