New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | = 3673474 | 104 (1.230) | coding (479/891 nt) | PP_3237 | universal stress protein family protein |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CCTGGAACACGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTG > NC_002947/3673289‑3673586 | ccTGGAACACGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCC < 2:837860‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGAACACGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCg > 2:1492414/1‑150 (MQ=255) aggAACGCGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGa < 1:34067/149‑1 (MQ=255) acGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGc > 2:2203964/1‑150 (MQ=255) gTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCcg > 2:1307840/1‑150 (MQ=255) cATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCacgtccaccgcc > 2:1612314‑M1/1‑138 (MQ=255) aTGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCgcgc < 2:2162073/150‑1 (MQ=255) aTGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTc < 1:718688/150‑1 (MQ=255) tGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCacgtccaccgccgccacgac < 1:1612314‑M1/150‑21 (MQ=255) ccGACCGGACCTGCTCCTCAAGCAGGTCGAGCATCCGCCCGCACTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGCTCCCGGTCTACCTGCTCGGTGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGt < 2:822052/149‑1 (MQ=255) gACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCa > 1:1760607/1‑142 (MQ=255) ctgctgCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTg > 2:867277/1‑150 (MQ=255) ctgctgCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTg > 1:216125/1‑150 (MQ=255) 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aaCCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTgccttggcctt < 1:1642722/113‑1 (MQ=255) ccGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaaggcgcgcttgagcgcgggctcat > 2:1177990‑M2/1‑42 (MQ=255) ccGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaaggcgcgcttgagcgcgggctcat < 1:1177990‑M2/139‑98 (MQ=255) cGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTTGCCGACACCTCGATATATGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACTCCTGCGAt < 1:615277/150‑1 (MQ=255) cGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGAt > 1:1902183/1‑150 (MQ=255) ggCCacgtccaccgccgccacgacctggcgcggcaacgtcggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaag < 2:590292‑M1/115‑112 (MQ=255) ggCCacgtccaccgccgccacgacctggcgcggcaacgtcggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaag > 1:590292‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCacgtccaccgccgccacgacctggcgcggcaacgtcggccggttggccccgagcagggagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaaggcgcgcttgagcgcgggctcatgctcgacctgcttg > 2:2069412‑M1/1‑3 (MQ=255) gCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTgcctt < 2:1718329/102‑1 (MQ=255) gCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCt < 1:1317633/150‑1 (MQ=255) ccacgtccaccgccgccacgacctggcgcggcaacgtcggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaaggcgcgcttgagcgcgggctcatgctcgacctgcttga > 1:1589093‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCTGGAACACGTCATGGAGATGCGACCGGACCTGCTGCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTG > NC_002947/3673289‑3673586 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |