New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATGGGCTATGC > NC_002947/3673325‑3673618 | gctCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCTCCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGt < 2:2116197/150‑1 (MQ=255) tCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTgg > 1:1589093‑M2/1‑148 (MQ=255) cAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTCCCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTggc > 2:2069412‑M2/1‑147 (MQ=255) 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aGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATgg < 2:177010/150‑1 (MQ=255) aGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATgg > 1:902761/1‑150 (MQ=255) ggcggcGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACAt < 1:851897/150‑1 (MQ=255) gcggcgGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATg > 2:1905489/1‑150 (MQ=255) ggcggTGGACGTggccggttggccccgagcaggtagaccgggaccgggcagtggcgcaacagtttccagtcaagcggggtgaagaaggcgcgcttgagcgcgggctcatgctcgacctgcttgagcagcaggtccggtcgcatctccatg > 2:1612314‑M2/1‑12 (MQ=255) ggcggTGGACGTGGCCGACCCCTCGGAAGAGGGGCAAGCTCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATggg < 2:1874479/150‑1 (MQ=255) gcggTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATGGGc < 2:944219/150‑1 (MQ=255) cggTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCTTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATGGGCt < 1:1890858/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATGGGCTATg < 2:855324/150‑1 (MQ=255) | GCTCAAGCAGGTCGAGCATGAGCCCGCGCTCAAGCGCGCCTTCTTCACCCCGCTTGACTGGAAACTGTTGCGCCACTGCCCGGTCCCGGTCTACCTGCTCGGGGCCAACCGGCCGACGTTGCCGCGCCAGGTCGTGGCGGCGGTGGACGTGGCCGACACCTCGGAAGAGGGGCAAGCCCGAAATGACAGCATCGTCCAGCAGGCCAGTGCCTTGGCCTTGCAGACAGGGGCGCAACTGGACCTGCTGCACGCCTGCGATCTGTCGATGGCCTACATGGGCGACATGGGCTATGC > NC_002947/3673325‑3673618 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |