| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 3928414 | 95 (1.080) | 11 (0.140) | 8/220 | NT | 11.0% | intergenic (+46/‑94) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3928431 | 94 (1.200) | intergenic (+63/‑77) | peaE/PP_3464 | phenylacetaldehyde dehydrogenase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCGCCAGCCA > NC_002947/3928266‑3928563 | gTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTa > 2:1206568/1‑150 (MQ=255) gTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTa < 1:1206568/150‑1 (MQ=255) tttGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTAt > 1:476732/1‑150 (MQ=255) tggtggCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGATGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGCTCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca < 1:459923/150‑1 (MQ=255) cTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTa < 2:1018180/141‑1 (MQ=255) cTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTa > 1:1018180/1‑141 (MQ=255) tACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGccc < 1:2194336/150‑1 (MQ=255) cAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtg < 2:941714‑M1/150‑20 (MQ=255) aaGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgt > 1:2216327‑M2/1‑147 (MQ=255) aGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgta > 2:1306860‑M2/1‑146 (MQ=255) aGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgta > 1:967097‑M2/1‑146 (MQ=255) aGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgta < 1:2017531‑M2/150‑5 (MQ=255) gTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggag > 1:971096‑M2/1‑142 (MQ=255) tCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGATCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagc < 1:305160‑M1/150‑27 (MQ=255) tCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagc < 1:644831‑M2/150‑10 (MQ=255) tGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgg < 1:1831523‑M1/150‑29 (MQ=255) tGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca < 1:1560996/132‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATca > 2:1560996/1‑132 (MQ=255) 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ccGCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcca > 2:1540205‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgcca < 2:658034‑M2/150‑123 (MQ=255) ccGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccggcacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaac < 2:1879472‑M2/146‑119 (MQ=255) cGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGcccc > 1:1432285/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgccaga < 1:644831‑M1/150‑142 (MQ=255) cTCCTACAgggcttgtgatgtttggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaccccatctcacgaccaacgccagac < 1:1022859‑M1/150‑143 (MQ=255) tCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGccccaga > 2:1171136/1‑147 (MQ=255) tACAgggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgccagacatct > 1:967097‑M1/1‑4 (MQ=255) acacCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaa < 2:1576973‑M2/81‑62 (MQ=255) acacCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaa > 1:1576973‑M2/1‑20 (MQ=255) cacCAGGTATCACATGCCCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcaacaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctcacgaccaacgccagacatcttg < 1:1957993‑M2/150‑132 (MQ=255) agggcatgtgatacctggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggtacaggaaaaaggatcagagcttgatcatcaccgatttcagctccgtgtaatgctcgatggccgctgaacccatctca < 1:603252‑M1/128‑128 (MQ=255) acCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgccagcca > 2:2163270/1‑150 (MQ=255) acCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCgccagcca > 2:1304450/1‑150 (MQ=255) | GCTGCCGTTTGGTGGCTACAAGATGTCTGGCGTTGGTCGTGAGATGGGTTCAGCGGCCATCGAGCATTACACGGAGCTGAAATCGGTGTTGATCAAGCTCTGATCCTTTTTCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAGGTATCACATGCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACAAAAAAACAACAATAAAAACCATGGAGCAACCCCATGAGGCACACACTCGCCTGCACATTGGCCCTGCTGTTAACCGCCCCCGCCAGCCA > NC_002947/3928266‑3928563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |