| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4700803 | 73 (0.830) | 10 (0.130) | 7/220 | NT | 11.6% | intergenic (‑70/+80) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C |
| ? | NC_002947 | = 4700847 | 87 (1.110) | intergenic (‑114/+36) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGA > NC_002947/4700654‑4700950 | cAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:458369/1‑150 (MQ=255) agcgcttgcaagccttgctggaacaggccaccctccacccattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcattgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGggttga < 1:103787‑M1/16‑3 (MQ=255) acacCTTCCGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCTCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTGTACGTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1656956/150‑1 (MQ=255) acacCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1972998/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACATCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAt > 2:546333/1‑150 (MQ=255) ttCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:1500554/148‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1500554/1‑148 (MQ=255) cggccccggccGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTCACAAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGCGCGGATCTAGCCGCGAATACGTCAg > 1:632619/1‑150 (MQ=255) ggccccggccGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGt < 2:1935624/150‑1 (MQ=255) ccccggccGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACCCACGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTgg > 2:1363964/1‑150 (MQ=255) cggTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGcaccacc > 1:1663059/1‑150 (MQ=255) tGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCaccaccacc < 1:657018/150‑1 (MQ=255) cGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGc > 1:1278100/1‑150 (MQ=255) ggAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTc < 1:458369/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGAGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGt > 2:2211151/1‑125 (MQ=255) ggTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGAGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGt < 1:2211151/125‑1 (MQ=255) gTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaatgcggttgtggtgccactgacgtattcgcgg < 1:969177‑M1/150‑42 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcg > 1:1282615‑M1/1‑108 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcg < 2:1282615‑M1/148‑41 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCggg < 2:1141360/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTCTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACATGTAGGAGCGCGTTTACCCGCGAATCCGTCCGCGCCACCACCCCCCCACTCGCcgg > 2:495428/1‑150 (MQ=255) cattgctcggcccgccggtcgtcaacgtgctggccttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtgaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGACTACGTTAGTGTCACGACCACGTCATTCGCgg > 2:859634‑M1/96‑150 (MQ=255) cattgatcggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagacTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCgg > 2:2207202‑M1/96‑150 (MQ=255) cattgaccggcccgccggtggtcaacgtgctggcgttgaaccaggccttggaaaagctcgccattgtcaggtaatcgaagcgctggcaggaagccTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCgg > 1:2047612‑M1/96‑150 (MQ=255) cgcATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCCTCCTTTACTTTGTCCAACAGCCACGCC‑CTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgctc > 1:1779091‑M2/1‑141 (MQ=255) aggcGCAGGCGGAGGCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctaca > 2:133516‑M2/2‑136 (MQ=255) gcgcGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAgg > 1:1544213/1‑150 (MQ=255) gTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAg > 2:103787/1‑150 (MQ=255) gTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAg < 1:2026476/150‑1 (MQ=255) tCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:1143352/88‑1 (MQ=255) tCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:1143352/1‑88 (MQ=255) tCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAgc > 1:1149707/1‑150 (MQ=255) aCTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAgcgc > 2:1833015/1‑150 (MQ=255) aCTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAgcgc > 1:2198564/1‑150 (MQ=255) cTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACATGTACGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTCCCTGCCAGCGCt > 2:1564018/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 2:2082317/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 2:1712690/1‑150 (MQ=255) tCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCtt > 1:1710613/1‑150 (MQ=255) aTGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgc > 1:250528‑M2/1‑116 (MQ=255) aTGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgc < 2:250528‑M2/123‑8 (MQ=255) cATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTAcc > 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tttGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGc < 1:1373129/150‑1 (MQ=255) tCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGc < 2:678095/150‑1 (MQ=255) cAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTtacccgcgaatgcggtggtggtgccactgac > 2:2304715‑M1/1‑50 (MQ=255) aCAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCtttt < 2:632619/150‑1 (MQ=255) tC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgctccta > 2:1107050‑M2/1‑88 (MQ=255) tC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgctccta < 1:1107050‑M2/100‑13 (MQ=255) 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GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAg > 2:1980213‑M1/1‑120 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcgga < 1:1107050‑M1/100‑89 (MQ=255) ggAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgc > 1:1664003‑M1/1‑10 (MQ=255) gAGCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagggcgtggctgttggacaaagtaaaggaggaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcg > 1:1779091‑M1/1‑9 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAAc < 1:2303817‑M1/128‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACcggcg < 1:2047697‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACcggcg < 1:1668499‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACcggcgg < 2:1246110‑M1/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacat > 1:250528‑M1/1‑7 (MQ=255) gCGGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacat < 2:250528‑M1/123‑117 (MQ=255) acgGGTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctgcacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcgct < 1:1045008‑M1/149‑144 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTgg > 1:1512485‑M1/1‑120 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCggg < 2:600343‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCCCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTgg < 2:1512485‑M1/120‑1 (MQ=255) ggTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggagtaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcgcggtt > 1:489720‑M1/1‑4 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcgctgtt < 1:2015227‑M2/150‑103 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggctttccctgaagcggcggactgttggacgaagtaaaggatgaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcgctgttg > 1:2046985‑M1/1‑3 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggc > 1:2123200‑M1/1‑3 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcggtggtggtgccactgacgtattcgcgggtaaacccgctcctacacgttaagggggc < 2:2123200‑M1/73‑71 (MQ=255) gTTcacccgcgaatgcagtggtagtgccactgacgtagtcgcgggtaaccccgctcatacacggacctgctgcggtccctgaagcggcggactgttggacaaagtaaaggatgaaacatgagtgactccgcccgcgccgatgcgctgttg < 1:42582‑M1/150‑148 (MQ=255) GTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGa > 1:546333‑M1/1‑150 (MQ=255) GTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGGTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGa < 1:75140‑M1/150‑1 (MQ=255) | CCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTC‑CGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGTCAGTGGCACCACCACCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGGCTTCCTGCCAGCGCTTCGATTACCTGACAATGGCGAGCTTTTCCAAGGCCTGGTTCAACGCCAGCACGTTGACCACCGGCGGGCCGA > NC_002947/4700654‑4700950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |